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    Nature子刊:最大、最精確的RNA編輯位點列表

    由布朗大學領導的一個研究小組編譯出了一份最大型、經最嚴格驗證的果蠅RNA編輯位點列表。該研究生成了關于這一模式生物基礎生物學的一些新見解,研究結果發表在9月29日的《自然結構和分子生物學》(Nature Structural & Molecular Biology)雜志上。 這一“主列表”總共包含了3,581個位點,在這些位點ADAR酶可以將RNA分子中的“A”核苷酸換成“G”核苷酸。這樣看似很小的改變意義卻很大,因為它改變了果蠅DNA中的遺傳指令執行的方式, 影響了包括正常的神經和性發育在內許多基礎功能。在人類,RNA編輯混亂與肌萎縮性側索硬化癥(ALS)及Acardi-Gutieres病密切相關。 這一新的編輯位點列表因此有可能幫助到數以千計從事“轉錄組”(transcriptome,由DNA轉錄生成的RNA分子)研究的科研人員,為他們提供了有關成千上萬可能發生的編輯改變的可靠信息。 論......閱讀全文

    基金委資助生物大分子動態修飾與化學干預項目 達4725萬

    分析測試百科網訊 近日,國家自然科學基金委發布了《生物大分子動態修飾與化學干預重大研究計劃2018年度項目指南》,對該項目的科學目標、核心科學問題、研究方向等進行規定。《指南》指出要充分發揮化學、生命科學和醫學的特點以及學科交叉的優勢,引領生物大分子動態修飾與化學干預研究,為生物大分子動態修飾的機制

    堿基編輯器的效能差異并構建可編輯致病突變數據庫

      近日,中國科學院上海營養與健康研究所楊力研究組與上海科技大學生命科學與技術學院陳佳研究組通過合作,系統揭示了一系列具有代表性的基因組堿基編輯器(baseeditor)的效能差異,并進一步構建了可利用20種已報道堿基編輯器進行編輯的人類疾病相關單堿基突變位點的數據庫(BEable-GPS, Bas

    2017年5月CRISPR/Cas亮點盤點

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。  

    CRISPR基因編輯結果全靠猜?No,部分可預測

      CRISPR-Cas9系統已成功用于多個生物的基因組編輯,然而,我們還不能很好地預測特定位點上的編輯結果。為此,英國弗朗西斯?克里克研究所的研究人員對近1,500個目標位點上的編輯結果進行系統分析,發現各個位點之間的編輯精確性差異很大。  研究人員發現,編輯精確性與編輯效率相關,并且可根據某些簡

    揭秘首次人類胚胎基因編輯 “中國貢獻”受關注

      美國首次編輯人類胚胎基因的研究2日正式發表在英國《自然》雜志上。該研究一周前遭媒體曝光,引發全球科技界廣泛關注。由于牽扯道德倫理問題,人類胚胎研究屢屢處于爭議之中。迄今,只有中美兩國實施過人類胚胎基因編輯,英國一個團隊則獲得政府的類似試驗許可。  那么,科學家出于何種考量要對人類胚胎基因“動刀”

    中國學者綜述:基因組編輯技術及其在昆蟲研究中的應用

      科學通報,中國科學C輯:生命科學,這兩份期刊均是由中國科學院和國家自然科學基金委員會共同主辦的,我國學術期刊中的知名品牌,被國內外各主要檢索系統收錄,如國內的《中國科學論文與引文數據庫》(CSTPCD)、《中國科學引文數據庫》(CSCD)等;美國的SCI、CA、EI,英國的SA,日本的《科技文獻

    RNA編輯領域前世今生

      提到基因編輯,我們可能首先想到的是著名學者張鋒和Jennifer Doudna博士共同發現的CRISPR基因編輯系統。而提到單堿基編輯系統,我們可能首先會想到Broad研究所著名科學家David Liu和張鋒博士等人共同創建的Beam Therapeutics公司,這家初創公司致力于使用基于CR

    進化分析揭示編碼區和非編碼區RNA編輯的功能調控效應

      2017年3月,國際知名學術期刊PLOS Genetics在線發表了斯坦福大學Jin Billy Li課題組和中山大學生命科學學院張銳課題組共同研究的題為“Evolutionary analysis reveals regulatory and functional landscape of c

    單堿基基因編輯研究進展速覽

      本文中,小編整理了近年來科學家們在單堿基基因編輯研究領域取得的新進展,分享給大家!  【1】Nat Commun:科學家首次在豬身上實現多位點單堿基編輯  doi:10.1038/s41467-019-10421-8  近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組利用單堿基編輯器首次在豬

    張建之教授PNAS解析RNA編輯

      如果一些編碼位點的RNA編輯受損,就會引起嚴重的疾病。因此,一些人認為編碼性RNA編輯是對人體有利的。   近年來的基因組研究顯示,人類基因組中有超過一千個編碼位點受到了RNA水平上的A(adenosine)-to-I(Inosine)編輯。許多這樣的RNA編輯事件屬于非同義替換。   現在

    2020年CRISPR/Cas最新研究進展

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    上海生科院等揭示RNA編輯表觀遺傳位點的系統進化規律

      7月28日,PLOS Genetics 雜志發表了中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所李軒研究組題為The landscape of A-to-I RNA editome is shaped by both positive and purifying selection 的研究論文。

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    中科院PLOS發表RNA編輯新成果

      7月28日,來自中科院上海生命科學研究院植物生理生態研究所李軒研究組、上海巴斯德研究所郝沛研究組以及密歇根州立大學王紅兵教授,在國際著名遺傳學期刊《PLOS Genetics》發表一項合作研究,題為“The Landscape of A-to-I RNA Editome Is Shaped by

    頻頻被“潑冷水” CRISPR/Cas基因編輯未來究竟何去何從?

       CRISPR/Cas這項基因編輯技術自從問世以來,已經吸引了無數歡呼和掌聲,在短短幾年之內,它已經成為了生物科學領域最炙手可熱的研究工具。然而它最近也頻頻被“潑冷水”,那么基因編輯未來究竟何去何從呢?  基因編輯技術指能夠讓人類對目標基因進行“編輯”,實現對特定DNA片段的敲除、加入等。CRI

    Nat Rev Genetics | 環狀RNA的合成與功能

      環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一種新興的內源性非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),是繼microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非編碼RNA家族中極具研究潛力的新成員。越來越多的研究表明,環狀RNA具

    曾經被全球唾棄的韓春雨,默默地發明了RNA成像系統

      近日,韓春雨在預印本網站BioRxiv發表了一篇關于基因編輯的新論文:Background free tracking of single RNA in living cells using catalytically inactive CasE.該研究開發了一種新型的活細胞RNA追蹤成像工具—

    基因組編輯:改碼生命,人定勝天

       谷峰1,高彩霞2  1溫州醫科大學附屬眼視光醫院 眼視光學與視覺科學國家重點實驗室,浙江 溫州 325000  2中國科學院遺傳與發育生物學研究所 基因組編輯中心 植物細胞與染色體工程國家重點實驗室,北京 100101  人類社會的發展是一個漫長的自然歷史過程,期間人類與自然界的不斷“摩擦與碰

    哈佛“大神”最新Cell:“魔剪”CRISPR為何越來越“牛”?

      David R. Liu現為哈佛大學化學與化學生物學教授、Howard Hughes醫學研究所研究員、Broad研究所Associate Member。他與張鋒、George Church等人是納斯達克CRISPR“第一股”Editas公司的聯合創始人。  筆者曾在《揭秘被IPO刷屏的Edita

    植物所發現四吡咯合成酶參與RNA編輯新機制

      四吡咯代謝途徑廣泛存在于動物、植物和微生物中,如人體內的血紅素以及植物的葉綠素都經該途徑合成,對包括呼吸作用和光合作用在內的生命活動具有不可缺少的作用。RNA編輯是真核生物的一種重要調控方式,可在基因序列不變的情況下產生蛋白質的多樣性。之前,人們尚不清楚四吡咯代謝途徑與RNA編輯兩個迥然不同的過

    2019年8月CRISPR/Cas最新研究進展

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    基因組分析揭示等位基因特異RNA編輯現象

      核糖核酸(RNA)編輯是RNA水平一種常見的修飾,是增加基因轉錄和功能多樣性的重要形式。17日,來自中科院昆明動物研究所的消息,由張亞平院士領導的、多個研究機構加盟的團隊,在等位基因特異的RNA編輯研究上取得了重要進展。  中科院昆明動物研究所周中銀博士介紹,對二倍體生物來說,雖然兩個等位基因的

    中國:“基因編輯”會不會重蹈干細胞治療覆轍?

      “抱歉。”黃軍就拒絕采訪,掛斷電話。這位中山大學35歲的副教授,在國際生物學界掀起一場倫理規范的“史詩”般的討論后,打算抽身。  2015年4月18日,國內期刊《蛋白質與細胞》在線發表了黃軍就團隊的研究——用基因編輯技術對人類胚胎進行基因改造。此前,黃軍就曾向世界知名期刊《自然》(Nature)

    利用單堿基編輯器實現多位點單堿基編輯DMD及HGPS豬模型

      6月28日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組在國際學術期刊Nature Communications(《自然-通訊》)發表了題為Efficient base editing for multiple genes and loci in pigs using base editors

    CRISPR女神創辦公司放“大招”

      CRISPR的火熱及其在臨床上應用的美好愿景,令這一技術相關的公司不斷涌現,除了張鋒等人創辦的Editas Medicine,Emmanuelle Charpentier等人的ERS Genomics,另外一位CRISPR先驅Jennifer Doudna也創辦了自家公司:Caribou Bio

    我國學者成功開發基于脫氨酶APOBEC的新型普適堿基編輯器

      中國科學院上海生命科學研究院(營養與健康院)中國科學院-馬普計算生物學研究所楊力研究組與上海科技大學生命學院陳佳研究組和黃行許研究組合作,成功開發出一系列基于人胞嘧啶脫氨酶APOBEC的新型普適堿基編輯器,其中基于人APOBEC3A(hA3A)的堿基編輯器可高效介導甲基化胞嘧啶mC到胸腺嘧啶T的

    重磅回顧!2015年“魔剪”CRISPR技術重大突破 TOP30

      CRISPR作為基因編輯領域的明星技術儼然已經成了眾多突破研究的“得力助手”。從技術改良、疾病治療到作物改良,越來越多的科學研究離不開這項才進入科研領域短短幾年的技術。張鋒、胚胎編輯、George Church等熱詞讓CRISPR在2015年“屢次刷屏”。  筆者從去年開始關注CRISPR技術,

    CRISPR/Cas9應用近期重大進展

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。  

    CRISPR技術如何帶火了基因編輯小鼠?

    2013年,一種名為的“CRISPR”的基因編輯技術出現后,“基因編輯”這個詞匯不經意間火了,傳遍了整個學術圈、生活圈,甚至是朋友圈。它的出現讓“編輯生命”變得觸手可及,它似乎可以斗過癌癥(白血病)和艾滋病,還有各種遺傳病。我們知道,目前這些人類疾病都沒有辦法從根本上治療,而它們幾乎都和基因突變相關

    北京大學Cell Res基因編輯研究新成果

      來自北京大學的研究人員報告稱,他們利用一種RNA導向的Cas9核酸酶在哺乳動物細胞和斑馬魚胚胎中有效實現了位點特異性基因編輯。相關論文“Genome editing with RNA-guided Cas9 nuclease in Zebrafish embryos”發表在3月26日的《細胞

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