單細胞核RNA測序技術建立了種子早期胚乳發育的轉錄圖譜
種子是裸子植物和被子植物特有的繁殖體，是胚珠經過受精以后形成的結構，在植物生命周期中處于關鍵位置。種子主要由種皮、胚和胚乳組成。其中胚乳是大多數開花植物雙受精后產生的組織，一般為三倍體（每個細胞核有三套染色體），胚乳中含有豐富的營養物質，是人類消耗熱量的主要來源。 基因組印跡是一種表觀遺傳基因調控過程，可以導致父系和母系遺傳等位基因的表達差異，胚乳是基因印跡的發生的主要部位。雖然胚乳在植物整個生育期中只是短暫的存在形式，但其經歷了一個獨特的發育過程，主要包括三個形態和空間上差異的結構域：珠孔結構域圍繞著胚；接合點結構域位于遠離胚的另一端；外周結構域位于中間。前期的研究已對三個胚乳區域的基因表達模式進行了分析，然而尚不清楚區域內是否存在細胞類型的異質性。此外，目前我們對胚乳生物學的了解也相對較少。 5月31日，來自美國的研究團隊在Nature Plants發表了題為Transcriptional and imprintin......閱讀全文
單細胞核RNA測序技術建立了種子早期胚乳發育的轉錄圖譜
種子是裸子植物和被子植物特有的繁殖體，是胚珠經過受精以后形成的結構，在植物生命周期中處于關鍵位置。種子主要由種皮、胚和胚乳組成。其中胚乳是大多數開花植物雙受精后產生的組織，一般為三倍體（每個細胞核有三套染色體），胚乳中含有豐富的營養物質，是人類消耗熱量的主要來源。 基因組印跡是一種表觀遺傳基因
研究揭示玉米胚乳早期發育新機制
4月8日，The Plant Cell 在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所巫永睿研究組題為Maize VKS1 Regulates Mitosis and Cytokinesis during Early Endosperm Development 的研究論文。該研
轉錄組測序與轉錄表達譜測序的異同
轉錄組測序可以得到特定條件下所有mRNA轉錄本的豐度信息，從而發現新的轉錄本和可變剪接體基因表達譜(gene expression profile)：指通過構建處于某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性cDNA文庫,大規模cDNA測序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群體組成,從而描繪該特
轉錄組測序和全轉錄組測序的區別
全轉錄組廣義上是指細胞在特定狀態下所能轉錄出來的?所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA?。借助高通量測序技術，可以全面獲取樣本中轉錄產物信息，結合競爭性內源RNA ( ceRNA)機制， 進行聯合分析，深入挖掘轉錄水平調控網絡。轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有
技術前沿空間轉錄組測序技術的展望
對生命過程的理解不光限于對組成個體的單個細胞的研究，更需要對細胞和細胞之間怎么樣的互作協調來完成一個整體的生物學功能的研究。空間組學技術的興起，使得在保留樣本空間位置信息的同時，檢測細胞中的基因表達等分子信息來勾勒出空間中的細胞表達特征。在2019年《Nature Reviews G
【技術前沿】空間轉錄組測序技術的展望
對生命過程的理解不光限于對組成個體的單個細胞的研究，更需要對細胞和細胞之間怎么樣的互作協調來完成一個整體的生物學功能的研究。空間組學技術的興起，使得在保留樣本空間位置信息的同時，檢測細胞中的基因表達等分子信息來勾勒出空間中的細胞表達特征。在2019年《Nature Reviews Genetic
技術前沿空間轉錄組測序技術的展望
對生命過程的理解不光限于對組成個體的單個細胞的研究，更需要對細胞和細胞之間怎么樣的互作協調來完成一個整體的生物學功能的研究。空間組學技術的興起，使得在保留樣本空間位置信息的同時，檢測細胞中的基因表達等分子信息來勾勒出空間中的細胞表達特征。在2019年《Nature Reviews Genetic
轉錄組測序原理
而轉錄組測序即是利用高通量測序技術，將細胞或組織中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 進行測序分析的技術。通過RNA-seq，也就是轉錄組測序，可以幫助我們了解各種比較條件下所有基因的表達差異包括：正常組織與腫瘤組織；藥物治療前后的表達差異；發育過程中，不同發育階段，不同組織的表達
illumina測序是轉錄組測序嗎
轉錄組測序屬于測序應用的一種，Illumina測序屬于測序技術的一種，兩者沒有包含于被包含關系，只能說Illumina測序可以做轉錄組測序。
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄組測序流程步驟
以真核轉錄組測序為例，實驗流程為總RNA提取-mRNA分離-建庫試劑-定量-文庫回收-橋式擴增-上機測序；項目分析流程為數據產出數據=數據去雜-轉錄組拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注釋-基因表達差異分析-差異基因表達模式聚類-差異基因富集分析。
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titanium第二代
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
Nature子刊發布重磅測序技術：基因組和轉錄組平行測序
四月二十七日的Nature Methods雜志上發布了一項引人注目的測序技術，G&T-seq（Genome and Transcriptome Sequencing）。該技術能夠實現大規模的DNA和RNA平行測序，同時展現單個細胞的基因組序列和基因活性。 研究人員用G&T-seq對220個小鼠
憑借測序技術，靈長類早期神經胚發育特征被揭示
出生缺陷嚴重影響國民健康。有數據顯示，當前已知的出生缺陷病種超過8000種，其中神經管畸形是常見的一類出生缺陷。出生缺陷的發生與早期胚胎發育異常直接相關。因此，研究早期胚胎發育過程、探究發育機理，是揭示病理性胚胎發生機制，提升相關疾病診療效率，從根源上提高人民健康水平的重要前提。搭建非人靈長類胚
水稻CTP合成酶參與調控胚乳早期發育的相關研究
胚乳是谷物的主要成分，儲存淀粉、蛋白質和其他幾種種子萌發和早期生長所需的營養物質,也是人體營養的重要來源。胚乳發育的鑒別特征之一是受精卵中心細胞在發育早期(合胞體階段)發生快速核分裂而沒有形成細胞壁，從而形成多核細胞谷物。核分裂在胚乳早期發育中起著決定種子大小的重要作用，然而，核分裂是如何調控這
RNA測序技術如何繪制全基因組轉錄終止？
近日，南方科技大學生命科學學院翟繼先團隊利用納米孔單分子RNA測序技術繪制了擬南芥全基因組水平轉錄終止圖譜。該方法能同時捕獲包括已轉錄過polyA位點的 readthrough轉錄本、完成3’末端切割的5’或3’切割產物、以及已完成或正在進行多腺苷酸化（polyadenylation）的轉錄本在
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
全轉錄組測序文章
研究背景? ? ?? 長鏈非編碼RNA（Long noncoding RNA，lncRNA）普遍被認為是一類不能編碼蛋白的長鏈RNA。由于其序列較長，所以可以有較大的潛力形成多種復雜構象，從而通過不同生物學途徑發揮其作用。此外，由于其不具備蛋白編碼能力，因此此類RNA也主要由其堿基序列形成的高級
單細胞測序技術如何應用于癌癥的早期診斷？
單細胞測序技術應用于癌癥的早期診斷主要體現在以下幾個方面：??1. 檢測癌前細胞的變化：可以識別出處于癌前病變階段的細胞中基因表達和表觀遺傳的異常，這些異常可能是癌癥發生的早期信號。??2. 發現罕見的腫瘤細胞亞型：在癌癥早期，腫瘤細胞的數量可能很少，但單細胞測序能夠檢測到這些少量的、具有獨特特征的
全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制（一）
2月7日，加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序，結合后續的功能機制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制！該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Circ
空間轉錄組測序技術在腫瘤研究進展的應用
空間轉錄組測序技術是一種基于組織空間結構進行高通量轉錄組測序的技術。通過該技術，可以得到組織空間位置的基因表達圖譜。因此，空間轉錄組技術是現階段可實現空間二維基因表達檢測的高通量技術。該技術為基于空間的發育研究和疾病異質性問題提供了一個解決方案。 空間轉錄組測序運用方向（Trends Bi
全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制（二）
3. 環狀RNA的差異表達與前列腺癌的進展有關研究者對144個前列腺癌進行了聚類分析，與線性RNA相比，環狀RNA最強模式與它們在每個樣本中的總體豐度相一致。另外，極端circRNA分布的患者的預后明顯較circRNA分布穩定的患者差，同時極端circRNA index組也與更高的轉移發生率
空間轉錄組測序技術在腫瘤研究進展的應用
空間轉錄組測序技術是一種基于組織空間結構進行高通量轉錄組測序的技術。通過該技術，可以得到組織空間位置的基因表達圖譜。因此，空間轉錄組技術是現階段可實現空間二維基因表達檢測的高通量技術。該技術為基于空間的發育研究和疾病異質性問題提供了一個解決方案。空間轉錄組測序運用方向（Trends Biotechn
中科院學者Nature－Protocols：空間轉錄組測序新技術
在真核細胞中，轉錄組的空間組織已經成為調節RNA轉錄后命運的一種有力手段，但是一般研究采用的是原位雜交或者原位的熒光染色，這項技術操作困難且通量低。近期來自中科院生物化學與細胞生物學研究所細胞生物學國家重點實驗室等處的研究人員作建立了一種可以獲得具有空間位置信息的少量細胞轉錄組圖譜的技術方法：G
上海生科院在玉米胚乳儲存蛋白基因轉錄調控中取得進展
7月29日，《遺傳學》（Genetics）雜志在線發表了中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所巫永睿研究組題為Divergent Transactivation of Maize Zein Storage Genes by the Transcription Factors Opaque