如何利用BankIt向NCBI在線提交序列
相關專題向NCBI提交序列常用的方法有兩種，其一是在線提交的BankIt，其二是用軟件Sequin。在此結合網絡牛人實際操作經驗來總結下如何通過BankIt在線提交DNA 或RNA序列，供參考。1.整理序列信息：包括病原采集地、病原的寄主、寄主癥狀、采集人等基本信息;還有序列分析結果，包括序列全長大小，開放閱讀框(ORF)的長度、位置及特定ORF序列翻譯的氨基酸 序列等基因水平的信息，這對于接下來的快速準確提交序列及提交成功后為全世界其他作者準確全面分享此類信息很重要;2.登陸BackIt站點，注意到頁面右邊的“Sign in to use BankIt”標簽，點擊登錄進入。如果沒有賬號就注冊一個(注意，此賬號與ncbi 賬號不通用)。附 注冊賬號步驟，需要填寫的項目為：Title：你的職位或頭銜First name：名last name：姓login：登陸名Affiliation：所屬機構地址，一般填寫自己......閱讀全文
如何利用BankIt向NCBI在線提交序列
相關專題向NCBI提交序列常用的方法有兩種，其一是在線提交的BankIt，其二是用軟件Sequin。在此結合網絡牛人實際操作經驗來總結下如何通過BankIt在線提交DNA?或RNA序列，供參考。1.整理序列信息：包括病原采集地、病原的寄主、寄主癥狀、采集人等基本信息;還有序列分析結果，包括序列全長大
如何利用BankIt向NCBI在線提交序列
向NCBI提交序列常用的方法有兩種，其一是在線提交的BankIt，其二是用軟件Sequin。在此結合網絡牛人實際操作經驗來總結下如何通過BankIt在線提交DNA?或RNA序列，供參考。1.整理序列信息：包括病原采集地、病原的寄主、寄主癥狀、采集人等基本信息;還有序列分析結果，包括序列全長大小，開放
如何在NCBI上查找引物序列
在NCBI中BLAST引物（注意選擇BLAST的數據庫），然后再Blast結果中找尋符合要求的序列。后面會列出很多鏈接，直接就能看到NCBI號 進入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&
如何在NCBI上查找引物序列
在NCBI中BLAST引物（注意選擇BLAST的數據庫），然后再Blast結果中找尋符合要求的序列。后面會列出很多鏈接，直接就能看到NCBI號 進入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&
NCBI使用方法之二：如何查找連續的mRNA、cDNA、蛋白序列
1、進入NCBI主頁在search后面選擇Gene，在for后面填寫需要查找的基因的名字。點擊“Go”，出現了很多基因序列，在每個序列的右邊還有“Order cDNA?clone” 的鏈接，這些序列中有些序列是跟你的目的基因同名的，有些是別名（Other Aliases）與你的目的基因一致，根據每個
NCBI－GenBank數據庫的起源、功能和常遇問題及解答
GenBank數據庫功能為一、提交獲取的基因序列；二、查找已知基因的序列生物學特性信息，例如編碼區，科學命名等。那么Genebank ID 和Gene cluster ID又是什么呢？ GenBank數據庫起源 GenBank數據庫是1982年由美國國立生物技術信息中心(NCBI)建
NCBI使用方法之一：Map－viewer查找基因序列，RNA，啟動子
下面以人的IL6（白細胞介素6）為例講述一下具體的操作步驟 一、打開Map viewer頁面，網址為 在search的下拉菜單里選擇物種，for后面填寫你的目的基因。 ? 二、點擊“GO”： 三、在步驟二圖示的右下角有一個Quick Filter,下面是讓你選擇的幾個復選框，在Gene前面的小方框
NCBI使用方法之一：Map－viewer查找基因序列，RNA，啟動子
下面以人的IL6（白細胞介素6）為例講述一下具體的操作步驟一、打開Map viewer頁面，網址為在search的下拉菜單里選擇物種，for后面填寫你的目的基因。二、點擊“GO”：三、在步驟二圖示的右下角有一個Quick Filter,下面是讓你選擇的幾個復選框，在Gene前面的小方框里打勾，然后點
GenBank數據庫概述（一）
1. GenBank屬于一個序列數據庫的國際合作組織，包括EMBL和DDBJ。是NIH遺傳序列數據庫，一個所有可以公開獲得的DNA序列的注釋過的收集。GenBank同日本和歐洲分子生物學實驗室的DNA數據庫共同構成了國際核酸序列數據庫合作。唯一人類基因序列集合（UniGene），人類基因組基因圖
如何快速查找LncRNA序列？
查找LncRNA序列的網站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數據庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。?Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov
如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的網站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數據庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。 一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。 1. Genebank：https://www.ncb
新研究利用DNA序列追溯植物演化關鍵事件
來自北美、歐洲和中國的科學家最新研究揭示了地球植物演化過程中的重要過渡細節，該研究成果于2014年10月27日發表在《美國科學院院刊》上。 從外來藻類植物、苔蘚植物、蕨類植物、生長在潮濕熱帶雨林中的花草樹木、人們食用的谷子、蔬菜到家中的觀賞植物，地球上的現生植物共同經歷了長達十億多年的歷史。
使用NCBI設計引物的教程
引物設計是PCR實驗的關鍵步驟之一。正確的引物設計能有效提高實驗的成功率。NCBI提供了一些強大的工具來輔助引物設計，本文將詳細介紹如何使用NCBI工具設計引物。一、了解NCBI標記類別在NCBI中，常見的標記符號通常以兩個字母開頭，后接一組數字。這些符號表示不同類型的序列，對于選擇正確的模板序列至
生物信息學應用：序列分析，電子克隆等初探
生物信息學可指利用信息技術管理和分析生物學數據。這就意味著生物信息學所涉及的范圍相當廣泛，從人工智能、機器人一直到基因組(genome)分析。就基因組分析這一角度來看，生物信息學主要是指核酸和蛋白質序列數據的計算機處理和分析。近年來，蛋白質結構數據的快速增長，使蛋白質三維結構的處理分析也歸入到生物信
核酸序列的一般分析流程
1.1 核酸序列的檢索?http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide?1.2 核酸序列的同源性分析?1.2.1 基于NCBI/Blast軟件的核酸序列同源性分析?http://www.ncbi.nlm.nih.gov/b
核酸序列分析的一般流程
1.1 核酸序列的檢索?http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide?1.2 核酸序列的同源性分析?1.2.1 基于NCBI/Blast軟件的核酸序列同源性分析?http://www.ncbi.nlm.nih.gov/b
核酸序列的一般分析流程
核酸序列的一般分析流程1.1 核酸序列的檢索http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast軟件的核酸序列同源性分析 http://www.nc
如何獲取漂亮的ClustalX序列比對圖片
發表論文當然需要一些質量高的圖片，那么如何將ClustalX序列比對的結果轉化成比較漂亮的圖片呢？小編在此搜集了一個還不錯的教程，分享給大家。多序列比對在分子生物學中是一個基本方法，用來發現特征序列，進行蛋白分類，證明序列間的同源性，幫助預測新序列二級結構與三級結構，確定PCR?引物，以及在分子進化
如何獲取漂亮的ClustalX序列比對圖片
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如何獲取漂亮的ClustalX序列比對圖片
發表論文當然需要一些質量高的圖片，那么如何將ClustalX序列比對的結果轉化成比較漂亮的圖片呢？小編在此搜集了一個還不錯的教程，分享給大家。多序列比對在分子生物學中是一個基本方法，用來發現特征序列，進行蛋白分類，證明序列間的同源性，幫助預測新序列二級結構與三級結構，確定PCR?引物，以及在分子進化
如何設計基因cds序列的pcr引物
提取細胞總RNA然后用試劑盒反轉錄成cDNA，用cDNA作為模板擴增基因的CDS區，然后想要轉染進細胞中。比如MYOD1基因，首先在NCBI找到它的mRNA序列，然后找到它的CDS序列，全部復制下來，在primer5.0中。正向引物直接從CDS的第一個核酸開始（比如18bp），反向引物從CDS最后一
NCBI－BLAST軟件比對結果詳細分析
NCBI BLAST比對結果報告分析:BLAST是NCBI開發的一款序列相似搜索程，常用在線的BLAST比對工具進行序列比對分析和引物設計。寫在解讀報告之前的，首先就使用Blast最終的目的是什么達成一致，Blast是通過兩兩比對，找到數據庫中與輸入序列最相似的序列，或者說是最相似的序列片段。那么我
A－Collection－of－PlantSpecific－Genomic－Data－and－Resources－at－NCBI
The National Center for Biotechnology Information (NCBI) provides a data-rich environment in support of genomic research by collecting the biologi
NCBI－BLAST比對結果詳細分析
相關專題NCBI BLAST比對結果報告分析:BLAST是NCBI開發的一款序列相似搜索程，常用在線的BLAST比對工具進行序列比對分析和引物設計。寫在解讀報告之前的，首先就使用Blast最終的目的是什么達成一致，Blast是通過兩兩比對，找到數據庫中與輸入序列最相似的序列，或者說是最相似的序列片段
NCBI的使用指南之Map－viewer
Map viewer是NCBI?網站上提供的一個非常有用的尋找基因的工具，通過Map viewer你可以了解你感興趣基因在基因組中所處的位置、基因序列、內含子及外顯子的排列、基因的細胞遺傳學圖、EST.SNP等等許多有用的信息。進入Map viewer的方法如下：點擊NCBI首頁的Map viewe
NCBI－BLAST比對結果詳細分析
相關專題NCBI BLAST比對結果報告分析:BLAST是NCBI開發的一款序列相似搜索程，常用在線的BLAST比對工具進行序列比對分析和引物設計。寫在解讀報告之前的，首先就使用Blast最終的目的是什么達成一致，Blast是通過兩兩比對，找到數據庫中與輸入序列最相似的序列，或者說是最相似的序列片段
如何查找質粒圖譜
方法一：使用Vector NT 軟件 做分子實驗，經常和不同的質粒打交道，了解各種質粒的圖譜信息是必需的，invitrogen公司的這款軟件絕對是分子生物學蟲子們的福音，要想對質粒圖譜了解更直觀，安裝這款軟件是非常必要的。這款軟件的軟件包里面會包括invitrogen公司的所有質粒圖譜信息和
一步步教你利用Blast分析驗證引物序列
引物設計完成之后，需要用軟件 進行分析，找到最佳的引物對，采用Blast分析驗證引物，可以知道序列的正確性，也能知道引物的特異性狀況、引物的具體位置以及PCR產物的大小。先找到需要設計引物的目標基因的在有引物序列的mRNA序列，可以通過全文（如最先發現該基因的文章），全文中有時可以找到大鼠c-jun
一步步教你利用Blast分析驗證引物序列
引物設計完成之后，需要用軟件 進行分析，找到最佳的引物對，采用Blast分析驗證引物，可以知道序列的正確性，也能知道引物的特異性狀況、引物的具體位置以及PCR產物的大小。先找到需要設計引物的目標基因的在有引物序列的mRNA序列，可以通過全文（如最先發現該基因的文章），全文中有時可以找到大鼠c-jun
中國高校如何向世界講好“故事”
近日，南京大學擬在《自然》刊發校慶特刊一事引發熱議。而事實上，在國際期刊發特刊，已經是不少高校校慶的慣常做法，折射出中國高校強烈的對外傳播需求。 在“雙一流”建設和高水平大學建設的背景下，對外傳播是我國高校促進國際交流、提升影響力的重要途徑。北京師范大學不久前發布的《2