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  • NCBI使用方法之一:Mapviewer查找基因序列,RNA,啟動子

    下面以人的IL6(白細胞介素6)為例講述一下具體的操作步驟 一、打開Map viewer頁面,網址為 在search的下拉菜單里選擇物種,for后面填寫你的目的基因。 二、點擊“GO”: 三、在步驟二圖示的右下角有一個Quick Filter,下面是讓你選擇的幾個復選框,在Gene前面的小方框里打勾,然后點擊Filter: 說明一下:1、染色體的紅色區域即為你的目的基因所處位置。2、下面參考序列給出了三個,是不同的部門做出來的,經我驗證,序列有微小的差異,但總體來說基本相同。盡管你分別點擊后,序列代碼、序列代碼等有所差異,但堿基基本一致,不影響大家研究分析序列。現在普遍采用的是最上面的那個序列,這一條是世界范圍的生物科學家用計算機合成的一個序列。我也推薦大家使用這個序列。 四、點擊上述三條序列第一條序列(即reference)對應的"Genes seq",出現新的頁面, 五、點擊上圖出現......閱讀全文

    如何確定非編碼rna的啟動子?

      長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是長度大于 200 個核苷酸的非編碼 RNA。研究表明, lncRNA 在劑量補償效應(Dosage compensationeffect)、表觀遺傳調控、細胞周期調控和細胞分化調控等眾多生命活動中發揮重要作用,成為遺傳學

    信使RNA的啟動子和轉錄因子

      一定義:酶識別、結合、開始轉錄的一段DNA序列。強啟動子2秒鐘啟動一次轉錄,弱啟動子10分鐘一次。  二原核生物:大腸桿菌在起點上游約-10堿基對處有保守序列TATAAT,稱為pribnow box,有助于局部解鏈。在其上游還有TTGACA,稱為-35序列,提供RNA聚合酶識別的信號。  三真核

    RNA干涉實驗——采用RNA聚合酶Ⅲ啟動子表達siRNA分子

    實驗方法原理因為哺乳動物細胞不具備低等真核生物細胞所具有的擴增 RNAi 信號的機制,因此人工合成或體外轉錄的 siRNA 分子在細胞內的作用是瞬時性的,不適合用于進行靶基因的表達受到抑制后細胞表型的長期變化觀察,也不適于進行文庫的篩選。此外,體外制備 siRNA 分子的成本比較高,而且 siRNA

    T7-RNA聚合酶/啟動子表達實驗

    基本方案 備選方案 備選方案2 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 載體 試劑、

    T7-RNA聚合酶/啟動子表達實驗

    實驗材料 載體試劑、試劑盒 氨芐青霉素卡那霉素pGP裂解緩沖液儀器、耗材 培養箱分光光度計離心機實驗步驟 1. ?將含有待表達基因的片段亞克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,轉化一種標準大腸桿菌菌株,此菌株不應帶有可指導T7 RNA聚合酶合成的質粒。轉化物涂布于氨芐青霉素平皿,于37℃溫育培養

    T7-RNA聚合酶/啟動子表達實驗2

    實驗材料蛋白質試劑、試劑盒氨基酸混合物M9培養基甲硫氨酸甲醇儀器、耗材熒光顯微鏡離心機分光光度計實驗步驟1. ?將含有待表達基因的片段亞克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,轉化一種標準大腸桿菌菌株,此菌株不應帶有可指導T7 RNA聚合酶合成的質粒。轉化物涂布于氨芐青霉素平皿,于37℃溫育培養過

    T7-RNA聚合酶/啟動子表達實驗3

    實驗材料噬菌體試劑、試劑盒PEGIPTG儀器、耗材培養箱離心機實驗步驟1. ?制備從M13噬菌體mGP1-2原種,加PEG溶液沉淀濃縮噬菌體。重懸噬菌體于M9培養基,滴定其滴度。?2. ?將由“基本方案”步驟1所得的含T7 啟動子表達質粒轉化M13許可性大腸桿菌細胞,轉化物涂布于氨芐青霉素平皿上,3

    T7-RNA聚合酶/啟動子表達實驗1

    在適宜的條件下,T7 RNA聚合酶/啟動子系統表達的基因產物可占細胞總蛋白的25%以上,但多數情況下產量比這個比例要低得多。實驗材料載體試劑、試劑盒氨芐青霉素卡那霉素pGP裂解緩沖液儀器、耗材培養箱分光光度計離心機實驗步驟1. ?將含有待表達基因的片段亞克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,轉化

    NCBI使用方法之一:Map-viewer查找基因序列,RNA,啟動子

    下面以人的IL6(白細胞介素6)為例講述一下具體的操作步驟 一、打開Map viewer頁面,網址為 在search的下拉菜單里選擇物種,for后面填寫你的目的基因。 ? 二、點擊“GO”: 三、在步驟二圖示的右下角有一個Quick Filter,下面是讓你選擇的幾個復選框,在Gene前面的小方框

    NCBI使用方法之一:Map-viewer查找基因序列,RNA,啟動子

    下面以人的IL6(白細胞介素6)為例講述一下具體的操作步驟一、打開Map viewer頁面,網址為在search的下拉菜單里選擇物種,for后面填寫你的目的基因。二、點擊“GO”:三、在步驟二圖示的右下角有一個Quick Filter,下面是讓你選擇的幾個復選框,在Gene前面的小方框里打勾,然后點

    啟動子是什么?

    啟動子 (promoter),是位于基因5'端上游緊靠轉錄起點的一段非編碼序列,其功能是引導RNA 聚合酶與基因相應部位的正確結合,啟動基因的轉錄。一般來說, 原核基因的啟動子比較簡單,只有數十個堿基組成,而真核基因的啟動子較大,可能涉及數千個堿基。啟動子有方向性, 位于結構基因轉錄起始點的

    啟動子分類介紹

    ①組成型啟動子(constitutive promoter)是指在該類啟動子控制下,結構基因的表達大體恒定在一定水平上,在不同組織、部位表達水平沒有明顯差異。使用最廣泛的組成型啟動子是花椰菜花葉病毒(CaMV)35S 啟動子、來自根癌農桿菌Ti 質粒T-DNA 區域的胭脂堿合成酶基因nos 啟動子,

    啟動子分類介紹

    ①組成型啟動子(constitutive promoter)是指在該類啟動子控制下,結構基因的表達大體恒定在一定水平上,在不同組織、部位表達水平沒有明顯差異。使用最廣泛的組成型啟動子是花椰菜花葉病毒(CaMV)35S 啟動子、來自根癌農桿菌Ti 質粒T-DNA?區域的胭脂堿合成酶基因nos 啟動子,

    啟動子解脫的定義

    中文名稱啟動子解脫英文名稱promoter escape定  義發生在真核生物基因轉錄起始過程后期的一個現象,即轉錄起始復合體形成后RNA聚合酶從啟動子上脫離,此后RNA聚合酶不再依賴啟動子就能繼續完成轉錄,但是轉錄的速度也因此而受到限制。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二

    啟動子封堵的概念

    中文名稱啟動子封堵英文名稱promoter occlusion定  義上游啟動子對下游啟動子的阻礙作用。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)

    啟動子阻抑的定義

    中文名稱啟動子阻抑英文名稱promoter suppression定  義由于轉錄抑制因子的作用或甲基化修飾等使啟動子活性減弱或喪失。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)

    翻滾啟動子的定義

    中文名稱翻滾啟動子英文名稱flip-flop promoter定 ?義可顛倒的啟動子。最早見于沙門氏菌的兩種鞭毛蛋白基因的交替表達。這些基因都受一個可以顛倒的DNA片段控制,在一個順式作用因子的調節下,這個片段從不同的方向驅動不同基因的表達,后來發現奇異變形桿菌的氯霉素抗性基因和珠蛋白基因等基因的表

    啟動子封堵的定義

    中文名稱啟動子封堵英文名稱promoter occlusion定 ?義上游啟動子對下游啟動子的阻礙作用。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)

    啟動子阻抑的定義

    中文名稱啟動子阻抑英文名稱promoter suppression定 ?義由于轉錄抑制因子的作用或甲基化修飾等使啟動子活性減弱或喪失。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)

    雜合啟動子的定義

    中文名稱雜合啟動子英文名稱hybrid promoter定  義由兩種或兩種以上不同啟動子元件融合構成的一個新的啟動子。如tac啟動子就是將色氨酸啟動子Ptrp-35區域與突變的乳糖啟動子PlacUV5的-10區域融合構成的雜合啟動子,兼具Ptac強啟動能力和乳糖啟動子可操控特性(受lacI產物的阻

    啟動子的功能介紹

    一個啟動子是一組DNA序列能使一個基因進行轉錄。啟動子是由RNA聚合酶所確認,并且引發轉錄。在RNA的合成中,啟動子是一種方法區分哪一個基因用作制造mRNA,及進而控制細胞制造哪一種蛋白質。

    啟動子解脫的定義

    中文名稱啟動子解脫英文名稱promoter escape定 ?義發生在真核生物基因轉錄起始過程后期的一個現象,即轉錄起始復合體形成后RNA聚合酶從啟動子上脫離,此后RNA聚合酶不再依賴啟動子就能繼續完成轉錄,但是轉錄的速度也因此而受到限制。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二

    雙向啟動子的定義

    雙向啟動子( bidirectional promoter)位于兩個相鄰且轉錄方向相反的基因之間 的一段DNA序列。

    啟動子清除的定義

    聚合酶轉錄時,首先結合到啟動子上,找到特異結合位點,激活后起始轉錄。?特異性結合的聚合酶-啟動子復合物連接緊密,如果轉錄要延長需要聚合酶的前進,只有脫離結合的啟動子才可以。聚合酶離開結合的啟動子以延伸轉錄產物的過程就叫啟動子清除。

    啟動子元件的功能

    中文名稱啟動子元件英文名稱promoter element定 ?義啟動子中的一些順式作用序列,可以位于啟動子的任何方向和任何位置(上游或下游)。可以被一些轉錄因子所識別,從而調節啟動子的活性。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)

    啟動子的基本結構

    啟動子是一段位于結構基因5'端上游區的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之與模板DNA準確地相結合并具有轉錄起始的特異性。因為基因的特異性轉錄取決于酶與啟動子能否有效地形成二元復合物,故RNA聚合酶如何有效地找到啟動子并與之相結合是轉錄起始過程中首先要解決的問題。有實驗表明,對許多啟動子來說

    克隆啟動子的方法

    隨著基因工程的發展,常常需要構建一種能高水平表達異源蛋白質的表達載體。啟動子對外源基因的表達水平影響很大,是基因工程表達載體的重要元件。因此研究啟動子的克隆方法,對研究基因表達調控和構建表達載體至關重要。迄今為止,國外尚未見到有關啟動子克隆方法的綜述性報道,國內僅孫曉紅等曾就啟動子的結構、分類、克隆

    啟動子清除的概念

    聚合酶轉錄時,首先結合到啟動子上,找到特異結合位點,激活后起始轉錄。 特異性結合的聚合酶-啟動子復合物連接緊密,如果轉錄要延長需要聚合酶的前進,只有脫離結合的啟動子才可以。聚合酶離開結合的啟動子以延伸轉錄產物的過程就叫啟動子清除。

    克隆啟動子的方法

    隨著基因工程的發展,常常需要構建一種能高水平表達異源蛋白質的表達載體。啟動子對外源基因的表達水平影響很大,是基因工程表達載體的重要元件。因此研究啟動子的克隆方法,對研究基因表達調控和構建表達載體至關重要。迄今為止,國外尚未見到有關啟動子克隆方法的綜述性報道,國內僅孫曉紅等曾就啟動子的結構、分類、克隆

    基因內啟動子的定義

    中文名稱基因內啟動子英文名稱intragenic promoter定 ?義被RNA聚合酶III識別的基因內的一段DNA序列。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)

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