如何獲取漂亮的ClustalX序列比對圖片
發表論文當然需要一些質量高的圖片,那么如何將ClustalX序列比對的結果轉化成比較漂亮的圖片呢?小編在此搜集了一個還不錯的教程,分享給大家。多序列比對在分子生物學中是一個基本方法,用來發現特征序列,進行蛋白分類,證明序列間的同源性,幫助預測新序列二級結構與三級結構,確定PCR 引物,以及在分子進化分析方面均有很大幫助,Clustal W(Dos版本)很適合這些方面的要求,Clustal X是window版本。用Clustal比對后的序列,有時候我們需要轉為圖片放在文章作詳細方析,但大部分人的方法都是直接截圖,這樣的后果就是圖片一點都不美觀。如果你是想要發表文章或其它比較重要的用途,圖片的質量還是需要高一點的。今天教大家如何把ClustalX的結果轉為漂亮的圖片的方法,你可以根據需要設置每一行顯示的字母數,是黑白的還是彩色的,夠酷吧。先來看個效果圖吧。這里需要用到兩個軟件 ,一個是Clustal X,這個就不......閱讀全文
如何獲取漂亮的ClustalX序列比對圖片
發表論文當然需要一些質量高的圖片,那么如何將ClustalX序列比對的結果轉化成比較漂亮的圖片呢?小編在此搜集了一個還不錯的教程,分享給大家。多序列比對在分子生物學中是一個基本方法,用來發現特征序列,進行蛋白分類,證明序列間的同源性,幫助預測新序列二級結構與三級結構,確定PCR?引物,以及在分子進化
如何獲取漂亮的ClustalX序列比對圖片
發表論文當然需要一些質量高的圖片,那么如何將ClustalX序列比對的結果轉化成比較漂亮的圖片呢?小編在此搜集了一個還不錯的教程,分享給大家。多序列比對在分子生物學中是一個基本方法,用來發現特征序列,進行蛋白分類,證明序列間的同源性,幫助預測新序列二級結構與三級結構,確定PCR?引物,以及在分子進化
如何獲取漂亮的ClustalX序列比對圖片
發表論文當然需要一些質量高的圖片,那么如何將ClustalX序列比對的結果轉化成比較漂亮的圖片呢?小編在此搜集了一個還不錯的教程,分享給大家。多序列比對在分子生物學中是一個基本方法,用來發現特征序列,進行蛋白分類,證明序列間的同源性,幫助預測新序列二級結構與三級結構,確定PCR?引物,以及在分子進化
序列比對之Clustalx與Clustalw使用指南
這幾天實驗需要做多序列比對,很久不做了,一時之間不知道如何使用clustal這個工具了。在網上搜集了一些資料,做個整理,總結了Clustalx和Clustalw的使用,省得以后久不使用又生疏了,又要去整理了,在此分享給大家,希望有所幫助。1.先提供下載地址:Clustalx、Clustalw的各種最
βTubulin抗體—做出漂亮WB和IHC圖片的內參
Tubulin即微管蛋白,是細胞的一種骨架蛋白。Tubulin分為α、β、γ、δ、ε等多種tubulin,其中α-Tubulin和β-Tubulin可以形成異源二聚體,是形成微管的最主要的兩種Tubulin。α-tubulin和β-tubulin分子量分別為55kDa和50kDa,其實際檢測條帶均在
獲取時間序列圖像
獲取時間序列圖像 ?共聚焦顯微鏡的"Time-Series"功能,可以自動在實驗者規定的時間內按照設定的時間間隔獲取圖像。只需設定所需的時間間隔以及所需圖像數量,開啟“Start T”功能鍵,即可進行實驗。“Time-Series"功能大大減輕了實驗者的勞動強度,對于熒光漂白恢復和鈣離子成像等實驗非
多序列比對的目標是什么?
多序列比對的目標是使得參與比對的序列中有盡可能多的列具有相同的字符,即使得相同殘基的位點位于同一列,這樣以便于發現不同的序列之間的相似部分,從而推斷它們在結構和功能上的相似關系,主要用于分子進化關系,預測蛋白質的二級結構和三級結構、估計蛋白質折疊類型的總數,基因組序列分析等。
多序列比對的實際應用2
模體和樣式前面敘述的方法對于多序列比對極為有用,但是用戶必須實現搜集好獨立的輸入序列,要么通過一系列的BLAST或其它的數據庫搜索,要么在實驗室里直接作出決定。但是,有太多的方法可以獲取一個單獨的序列,并且基于此序列中的任何模體或樣式,返回所有的蛋白質家族,完成某個特異方法所定義的最佳比對。很多時候
多序列比對的實際應用1
Andreas D.BaxevanisGenome Technology BranchNational Human Genome Research InstitudeNational Institutes of HealthBethesda.Maryland?在尋找基因和致力于發現新蛋白的努力中,人
構建多序列比對模型的方法介紹
手工比對方法手工比對方法在文獻中經常看到。因為難免加入一些主觀因素,手工比對通常被認為有很大的隨意性。其實,即使用計算機程序進行自動比對,所得結果中的片面性也不能予以忽視。在運行經過測試并具有比較高的可信度的計算機程序基礎上,結合實驗結果或文獻資料,對多序列比對結果進行手工修飾,應該說是非常必要的。
雙序列比對的背景及臨床意義
是序列分析的基礎·然而,對于構成基因家族的成組的序列來說,我們要建立多個序列之間的關系,這樣才能揭示整個基因家族的特征·多序列比對在闡明一組相關序列的重要生物學模式方面起著相當重要的作用。多序列比對有時用來區分一組序列之間的差異,但其主要用于描述一組序列之間的相似性關系,以便對一個基因家族的特征有一
多重序列比對及系統發生樹的構建
【實驗目的】1、熟悉構建分子系統發生樹的基本過程,獲得使用不同建樹方法、建樹材料和建樹參數對建樹結果影響的正確認識;2、掌握使用Clustalx進行序列多重比對的操作方法;3、掌握使用Phylip軟件構建系統發生樹的操作方法。【實驗原理】在現代分子進化研究中,根據現有生物基因或物種多樣性來重建生物的
如何把細胞養的更漂亮
不同的細胞,喜歡的環境是不一樣的。這個不僅僅是說培養基的不同,還有就是細胞生長的空間密度問題。有一些細胞是數量多一點比較好生長,生長情況也比較好。這種一般是歸于生長速度慢的細胞。比方內皮細胞。而有一些是細胞是數量少一點細胞情況會生長的比較好,比方巨噬細胞和某些腫瘤細胞。尤其是巨噬細胞,生長速度十分得
如何把細胞養的更漂亮?
? 1、對細胞君“量才適性” 不同的細胞,生長環境不同,除了細胞君其飲食習慣(培養基)的不同,還有就是細胞生長的空間密度問題。 有一些細胞就是喜歡熱鬧,對他們來說,數量多一點比較好生長,生長狀態也比較好。這種一般是屬于生長速度慢的細胞。比如內皮細胞。而有一些細胞則傾向于離群索居,數量少一點細胞狀
如何做出漂亮的革蘭氏染色
革蘭氏染色是一項經典的細菌鑒別手段,自19世紀80年代丹麥的醫師GRAM創立起,至今已經近一個半世紀,仍舊在細菌的檢測和鑒定分類上被廣泛應用著。在我國,GB 4789系列的國標中很多致病菌的檢測也都需要進行革蘭氏染色,可見其重要性。甚至可以說沒有精準掌握革蘭氏染色的微生物檢驗員,不會是一個合格
RNA電泳如何得出漂亮的條帶?
方法改進:1.電泳槽,制膠器,梳子等的清洗:去污劑浸泡過夜——>自來水沖洗干凈——>ddH20 沖洗——>3%H2O2 灌滿浸泡過夜——>滅活的 0.1%DEPC水沖洗干凈——>超凈臺內紫外線照射過夜.2.燒瓶,燒杯,藥匙,量筒等制膠器械的清洗:0.1%DEPC 水浸泡過夜后高壓消毒滅活,烘箱烘干.
多重序列比對及系統發生樹的構建實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 在現代分子進化研究中,根據現有生物基因或物種多樣性來重建生物的進化史是一個非常重要的問題。一個可靠的系統發生的推斷,將揭示出有關生物進化過程的順序,有助于我們了解生物進化的歷史和進化機制。 實驗步驟
多序列比對法的一般步驟
多序列比對一般通過3個步驟完成:(1)兩兩進行雙重比對。(2)生成一系統樹圖(dendrogram),將序列按相似性大致地分組。(3)使用系統樹圖作為引導,產生出最終的多序列比對結果。
多重序列比對及系統發生樹的構建實驗
實驗方法原理在現代分子進化研究中,根據現有生物基因或物種多樣性來重建生物的進化史是一個非常重要的問題。一個可靠的系統發生的推斷,將揭示出有關生物進化過程的順序,有助于我們了解生物進化的歷史和進化機制。實驗步驟一、用CLUSTALX軟件對已知DNA序列做多序列比對。操作步驟:1. ?以FASTA格式準
多重序列比對及系統發生樹的構建實驗(二)
2. ?文件outfile改為infile。點擊DNADIST程序。選項M是輸入剛才設置的republicate的數目,輸入D選擇data sets,輸入200。設置好條件后,輸入Y確認參數。程序開始運行,并在EXE文件夾中產生outfile,部分內容如下:將outfile文件名改為infile,為
多重序列比對及系統發生樹的構建實驗(一)
實驗方法原理在現代分子進化研究中,根據現有生物基因或物種多樣性來重建生物的進化史是一個非常重要的問題。一個可靠的系統發生的推斷,將揭示出有關生物進化過程的順序,有助于我們了解生物進化的歷史和進化機制。實驗步驟一、用CLUSTALX軟件對已知DNA序列做多序列比對。操作步驟:1. ?以FASTA格式準
流式軟件如何融合圖片
1、新建畫布:工具欄中“新建”——然后更改對話框中的各個選項即可。2、點擊選擇工具圖表中的“矩形選框工具m。3、框選流式圖主要部分。4、點擊右側的拖移工具v。5、將剛才選定的流式圖拖至新建的畫布中逐一調整大小、整齊度,再裁減保存即可。
基因序列排序與整理、數據庫比對與意義
由于定序系統的定序方法都是將體細胞內的基因序列打斷成很多段落后,再利用DNA擴增的方式原理,在擴增的同時借由偵測螢光的方式(將不同堿基原料接上螢光訊號,只要這有接訊號的堿基被合成了,即會發出不同強度的螢光訊號)即能得到大量的片段式基因序列。經數字化后的基因序列需經整理將每段落的頭尾相接成一個完整的基
掃描電鏡圖片如何分析
你的SEM圖片,工作電壓是5KV,放大倍數是40倍,你的樣品應該是顆粒狀的直接放置在導電膠上進行SEM測試的,通過這個圖片,可以看到你的樣品的形貌,大部分是規則的多面體顆粒,大小的話,這張圖片的尺寸標尺是100um,你的顆粒大小在400~600um之間
掃描電鏡圖片如何分析
第一、掃描電鏡照片是灰度圖像,分為二次電子像和背散射電子像,主要用于表面微觀形貌觀察或者表面元素分布觀察。一般二次電子像主要反映樣品表面微觀形貌,基本和自然光反映的形貌一致,特殊情況需要對比分析。背散射電子像主要反映樣品表面元素分布情況,越亮的區域,原子序數越高。第二、看表面形貌,電子成像,亮的區域
如何獲取精確的水分測試結果?
文章摘要:日常生活中,水無處不在,許多行業都需要對水分含量進行控制。測試方法、水分儀的位置、樣品制備等因素都會影響水分測試結果。本文以MB120鹵素水分儀為例,和大家一起探討如何獲取精確的水分測試結果。?如何獲取精確的水分測試結果?水在日常環境中無處不在,許多行業都需要對水分含量進行控制。常見的水分
如何做出一手漂亮的Western-Blot實驗結果?
蛋白質免疫印跡雜交實驗(Western Blotting)是成熟 mRNA 翻譯指導蛋白質合成量分析檢測手段中最經典和最廣泛為業界認可的一種,也是論文中最常見的數據呈現形式之一。雖然Western Blot實驗原理比較簡單,但是實驗耗時長、步驟繁瑣和實驗結果重復性差,導致剛進實驗室的小伙伴們
如何養出一盤飽滿漂亮細胞的基本要點
了解細胞生長習性?不同的細胞生長習性不同,了解細胞生長習性,正確計數,才能掌握好傳代密度。對于一般細胞株,控制在三天一傳,是比較合適的,細胞不會太擠。但例如癌細胞,一發起瘋來半天就可以傳代,不及時換液或擴增分分鐘會餓死或擠死。所以剛開始接觸一款細胞,要勤觀察,及時掌握它的生長情況。掌握細胞的生長節奏
如何構建分析方法
小編在后臺收到不少關于建樹的問題,今天轉載一篇PLoB的帖子,分享給大家,一起來看一下吧~ 方法的選擇 首先是方法的選擇。 基于距離的方法有UPGMA、ME(Minimum Evolution,最小進化法)和NJ(Neighbor-Joining,鄰接法)等。其他的幾種方法包括MP(Ma
為什么deSALT技術能夠突破長RNAseq讀序列比對瓶頸
由于高測序錯誤和復雜的基因結構,長讀RNA測序讀段的比對就顯得非常重要。2019年12月16號,哈爾濱工業大學臧天儀、王亞東團隊在Genome Biology上在線發表了題為deSALT: fast and accurate long transcriptomic read alignment