如何快速查找LncRNA序列？
查找LncRNA序列的網站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數據庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。 Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/2. Ensembl：http://asia.ensembl.org/index.html3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/二．根據“gene_id”查看LncRNA在所屬數據庫的ID號。 1. Genbank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/紅框內輸入gene_id號，點擊search。假設gene_id為AK009210。 點......閱讀全文
如何快速查找LncRNA序列？
查找LncRNA序列的網站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數據庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。?Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov
如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的網站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數據庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。 一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。 1. Genebank：https://www.ncb
PRC2與lncRNA相互作用的序列特異性研究獲進展
國際學術期刊《科學報告》（Scientific Reports）近期在線發表了中國科學院－馬普學會計算生物學伙伴研究所邵振研究組關于PRC2與長非編碼RNA（lncRNA）之間相互作用的序列特異性研究成果，題為The PRC2-binding long non-coding RNAs in hu
Sci－Rep：PRC2與lncRNA相互作用的序列特異性新發現
國際學術期刊《科學報告》（Scientific Reports）近期在線發表了中國科學院－馬普學會計算生物學伙伴研究所邵振研究組關于PRC2與長非編碼RNA（lncRNA）之間相互作用的序列特異性研究成果。 由多梳（PcG）家族蛋白組成的表觀調控復合物PRC2是控制動物組織發育的重要因子，但在
調控免疫的lncRNA
當過度活化或脫靶時，免疫系統中正常對抗感染的一些細胞會轉而攻擊個體自身的組織。這一過程會推動作為自身免疫性疾病組成部分的炎癥。現在，來自紐約大學Langone醫學中心的一項新研究揭示出了抑制這些機制的一種新方法，有可能會影響未來的藥物設計。相關論文 ? ?發布在12月16日的《自然》（Natur
lncRNA研究策略與技術
研究背景：長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是一類不編碼蛋白的RNA分子，長度在200 bp以上，起初被認為是RNA聚合酶II轉錄的副產物，不具有生物學功能；近期的研究表明lncRNA具有保守的二級結構，可以與蛋白、DNA和RNA相互作用，參與多種生物學過程的調控
lncRNA功能機制研究（二）
實驗路線（1）LINC00346調控胃癌發展的上游機制結果：轉錄因子KLF5和MYC可與LINC00346啟動子結合，并增強其表達a. 轉錄因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析；b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的轉錄因子
lncRNA功能機制研究（一）
文章導讀LncRNA是長度大于200nt的長鏈非編碼RNA，在調控不同的分子過程中發揮著重要作用。其主要功能不僅可以與功能蛋白結合，并在轉錄或轉錄后水平調控基因表達，而且lncRNA也可以作為誘餌，吸附miRNA，調節miRNA調控的靶基因表達。但是，目前關于lncRNA在胃癌中的表達譜和生物學功能
前導序列
中文名前導序列外文名leader sequence前導序列是結構基因中編碼區之前的一段序列，這部分序列能被轉錄，但不被翻譯，在mRNA是從5′端起至結構基因第一編碼子開始點（通常 AUG）為止，在蛋白質合成過程中不被翻譯。
eLife：lncRNA調控癌癥關鍵基因
Salk研究所的科學家們發現，一種長非編碼RNA(lncRNA)是癌癥發展過程中的一個關鍵基因開關。這項研究于四月二十九日發表在eLife雜志上，為相關癌癥的治療提供了一條新的途徑。 研究人員將這種lncRNA命名為PACER(p50-associated COX-2 extragenic
lncRNA表達與RNA的延伸
LncRNA的火熱研究已經有幾年的時間了，關于lncRNA總歸是有說不完的話題。目前對lncRNA的基礎分析都已形成了一定的模式。然后，今年來lncRNA的相關文章依然如雨后春筍。 長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是長度大于 200 個核苷酸的非編碼 RN
lncRNA甲基化如何研究？
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能，這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能輕松的變廢為寶，竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章，你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化，作為最新的國自然熱點受到
lncRNA助力葉酸研究新成果
LncRNA研究發表的成果五花八門，然而借助于lncRNA芯片，挖掘其中的高通量數據，發表5分影響因子的文章，還是可行的。本研究是以葉酸處理肥胖模型為基礎，讓我們來看看到底怎么樣就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》（IF=5.104）上發表。研究背
lncRNA的概念及形成過程
?lncRNA，即Long non-coding RNA，你可以把它理解為不表達蛋白的mRNA。它的很多特征與mRNA很類似。比如，它與mRNA一樣有啟動子、有polyA尾巴、有不同剪接、有動態表達水平。除了不表達蛋白這一點以外，僅從核苷酸水平上來看，可以說它與mRNA并無實質分別。所以對于設計PC
lncRNA在農業領域的研究成果（三）
【結論】①通過lncRNA測序，在上萬條白菜中候選的lncRNA中挑出了1,300余條與花粉授粉相關的lncRNAs。分析結果顯示一部分lncRNA在花蕾到授粉受精整個發育過程中持續表達，其余的部分為階段、部位特異性表達。lncRNA在白菜不同發育階段花蕾種的表達呈現出較明顯的差異，在V級花蕾中特異
如何研究lncRNA？三位科學家現身說法
人生如戲，相信長鏈非編碼RNA（lncRNA）也體會到了。之前一直遭冷遇，如今卻是萬人迷。其實，人類及其他哺乳動物的基因組轉錄了數萬條lncRNA。根據GenCode數據庫中最新版本的數據，人類基因組中包含16,000條lncRNA，產生了近28,000條轉錄本。再加上其他數據庫的數據，目前已知
長鏈非編碼RNA測序服務助力揭開lncRNA神秘面紗
2012年12月18日，華大基因科技服務有限公司(簡稱“華大科技”)在國內推出長鏈非編碼RNA測序(lncRNA-Seq)服務。該技術突破了常規研究方法效率低、研究范圍受限的瓶頸，可一次性獲得樣本中幾乎全部的lncRNA序列，不僅可以對已知lncRNA進行定量分析，還可對 novel lnc
Science：lncRNA究竟是大咖還是小角色？
RNA曾被認為只是細胞中的信使分子，后來人們逐漸意識到，RNA具有許多不同的形態和出人意料的功能。近年來，神秘的長非編碼RNA（lncRNA）受到了廣泛關注，它們的存在是否有意義一直是相關領域的熱點話題。 長非編碼RNA是長達兩百個核苷酸以上的RNA鏈，此前有研究指出lncRNA與發育、癌癥、
Nature重要發現：調控免疫的lncRNA
當過度活化或脫靶時，免疫系統中正常對抗感染的一些細胞會轉而攻擊個體自身的組織。這一過 程會推動作為自身免疫性疾病組成部分的炎癥。現在，來自紐約大學Langone醫學中心的一項新研究揭示出了抑制這些機制的一種新方法，有可能會影響未來 的藥物設計。相關論文發布在12月16日的《自然》（Nature）
Cell重要發現：調控免疫的lncRNA
由麻省大學醫學院Katherine A. Fitzgerald領導的研究小組證實，一種長鏈非編碼RNA lincRNA-EPS發揮轉錄剎車作用限制了炎癥。這一重要的研究發現發布在6月16日的《細胞》（Cell）雜志上。 細胞類型特異性的調控回路以復雜、動態和短暫調節的方式控制著基因表達。了解這
LncRNA芯片應用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范圍內，每年因肝癌死亡的病例超過50萬人，是主要的致死惡性腫瘤之一。在過去的十年中，隨著影像學的進步以及健康體檢的普及，越來越多的肝癌病人在患病早期被發現。但由于肝臟捐贈者的短缺，外科肝臟切除術仍然是治療早期肝癌病人的最主要方法。目前對于術后患者缺乏準確
LncRNA芯片應用于胃癌研究
上海交通大學附屬仁濟醫院房靜遠教授主要從事消化系統腫瘤發生的分子機制、早期診斷和分子治療等相關研究。近期，該課題組應用美國Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌組織的lncRNAs表達情況，篩選到可預測胃癌發生的分子標志物GClnc1，并且闡明了GClnc1在胃癌的發生和發展中是如何發揮
國際知名學者綜述：LncRNA分類
美國St. Laurent Institute的Philipp Kapranov教授，是基因組學與系統生物學領域具有重要國際影響的專家，長期從事系統生物學和基因組功能方面的研究，其發現人類基因組能夠產生大量的有功能作用的非編碼RNA，在概念層次上重新定義了“基因”，這一發現被Science選為最
帶你走進神秘的長鏈非編碼RNA
長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉錄本長度超過200nt的RNA分子，它們并不編碼蛋白，而是以RNA的形式在多種層面上（表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等）調控基因的表達水平。lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”，是RNA聚合酶II轉錄的副產物，不具有生物學功能。然而，近年來的研究
核酸序列分析
【實驗目的】1、?掌握已知或未知序列接受號的核酸序列檢索的基本步驟；2、?掌握使用BioEdit軟件進行核酸序列的基本分析；3、?熟悉基于核酸序列比對分析的真核基因結構分析（內含子/外顯子分析）；4、?了解基因的電子表達譜分析。【實驗原理】針對核酸序列的分析就是在核酸序列中尋找基因，找出基因的位置和
LncRNADILC阻礙肝癌干細胞更新和增殖
中國工程院院士、第二軍醫大學王紅陽教授課題組長期從事惡性腫瘤的基礎與臨床研究，對腫瘤發生發展的分子病理機制和細胞信號轉導有重要建樹。近期，該實驗室使用Arraystar LncRNA芯片發現了與肝癌干細胞的自我更新相關的分子--Lnc-DILC。高表達的Lnc-DILC可以競爭性結合IL-6，
LncRNADILC阻礙肝癌干細胞更新和增殖
中國工程院院士、第二軍醫大學王紅陽教授課題組長期從事惡性腫瘤的基礎與臨床研究，對腫瘤發生發展的分子病理機制和細胞信號轉導有重要建樹。近期，該實驗室使用Arraystar LncRNA芯片發現了與肝癌干細胞的自我更新相關的分子--Lnc-DILC。高表達的Lnc-DILC可以競爭性結合IL-6，阻
沖激序列信號與階躍序列信號各有什么特性
單位脈沖序列只在n=0 處有一個單位值1，其余點上皆為0；單位階躍序列只有在n>=0時，才取非零值1，當n
設計引物用cds序列和cdna序列的區別
cDNA和mRNA的序列是互補的，如果用兩個引物，最后的兩條DNA序列分別對應于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向從5‘至3’，所以兩個引物對應于mRNA和cDNA中相應序列即可。
我國科學家發現裸鼴鼠的LncRNA抗癌特性
近日，中國科學院昆明動物研究所孔慶鵬課題組研究發現裸鼴鼠的抗癌特性與長鏈非編碼RNA密切相關，相關成果發表在《表觀遺傳學與染色質》期刊上。 據了解，裸鼴鼠是嚙齒類動物中名副其實的長壽之星，其壽命可長達30年，而一般小鼠及大鼠的壽命僅有2~3年。此外，裸鼴鼠還具有天然的抗癌特性，因此裸鼴鼠在長