文章導讀
LncRNA是長度大于200nt的長鏈非編碼RNA，在調控不同的分子過程中發揮著重要作用。其主要功能不僅可以與功能蛋白結合，并在轉錄或轉錄后水平調控基因表達，而且lncRNA也可以作為誘餌，吸附miRNA，調節miRNA調控的靶基因表達。但是，目前關于lncRNA在胃癌中的表達譜和生物學功能的了解仍然有限；在本研究中，作者首先通過生物信息學分析胃癌lncRNA微陣列數據庫，發現LINC0034在胃癌中顯著高表達，且與胃癌具有臨床相關性，結果顯示顯示LINC00346在胃癌中反復擴增上調，其表達與病理分期差、腫瘤體積大、預后差呈正相關。然后探究了 LINC00346的體內外功能，實驗顯示LINC00346能夠影響胃癌生長、遷移和侵襲等生物學功能。作者也探究了LINC00346調控胃癌發展的上下游分子機制，上游機制顯示致癌轉錄因子KLF5和MYC可與LINC00346啟動子結合，并增強其表達；下游機制顯示LINC00346主要表達在胞質中，可通過ceRNA機制作為miR-34a-5p的分子海綿體，并通過吸附miR-34a-5p后調節其下游靶基因CD44、AXL、NOTCH1的表達并調控胃癌細胞的生物學功能。
綜上所述，該研究結果證明了KLF5、MYC/LINC00346/miR-34a-5p在胃癌發生發展中起關鍵作用的模型，為胃癌治療提供了新方向和思路。
發表期刊：Cell Death & Differentiation
影響因子：8.0
實驗方法：生信高級分析，轉錄組RNA測序，RIP，pulldown
測序樣本：過表達LINC00346的胃癌細胞（實驗組），轉染空載質粒的胃癌細胞（對照組）
文章內容
1. 生物信息學分析胃癌lncRNA微陣列數據庫，現LINC0034在胃癌中顯著高表達，且與胃癌具有臨床相關性
實驗路線
結果：LINC0034具有胃癌臨床相關性
a,b：LINC0034在胃癌中顯著高表達；c-d：LINC0034的表達與病理分期差、腫瘤體積大、預后差呈正相關。
2．探究LINC00346在胃癌中的體內外功能
實驗路線
結果1：體外探究LINC00346對胃癌細胞增殖、遷移和侵襲功能影響
a-b．克隆形成實驗探究細胞增殖能力；c. 流式細胞術實驗探究細胞周期組織情況；d. EDU免疫熒光染色實驗探究細胞增殖能力；e. Transwell和invasion實驗探究細胞遷移和侵襲能力。
結果2：體內探究LINC00346對胃癌在體內的生長和轉移的影響
a-h：裸鼠成瘤實驗
3．探究LINC00346調控胃癌發展的上下游分子機制研究