高通量測序技術實現繪制人類視網膜高精度發育細胞圖譜
人類胚胎發育從受精卵開始，經過著床前胚胎發育（胚內和胚外組織的產生），原腸胚產生（三胚層的特化）和器官發生等階段，最終新生兒出生。人類胚胎發育從單個細胞到上萬億個細胞，歷時二百八十天，整個過程的基因表達受到多種因素的精細調控，其中很多機制尚未明確。 為了解析人類胚胎發育各個階段的基因表達調控網絡，自2010年起，北京大學北京未來基因診斷高精尖創新中心、生命科學學院湯富酬課題組和北醫三院喬杰課題組就開始緊密合作，圍繞人類生殖系細胞（包括著床前胚胎細胞和著床后胚胎生殖細胞）發育的基因表達調控機制系統地開展研究工作（如圖1所示）。圖1.湯富酬課題組和喬杰課題組合作項目概覽 首先，應用湯富酬課題組發展的單細胞轉錄組高通量測序技術，湯富酬課題組和喬杰課題組繪制了完整的人類生殖系細胞的發育細胞圖譜，包括著床前胚胎的發育細胞圖譜（Yan et al., Nature Structural & Molecular Biology......閱讀全文
高通量測序技術實現繪制人類視網膜高精度發育細胞圖譜
人類胚胎發育從受精卵開始，經過著床前胚胎發育（胚內和胚外組織的產生），原腸胚產生（三胚層的特化）和器官發生等階段，最終新生兒出生。人類胚胎發育從單個細胞到上萬億個細胞，歷時二百八十天，整個過程的基因表達受到多種因素的精細調控，其中很多機制尚未明確。 為了解析人類胚胎發育各個階段的基因表達調控網
《細胞》：單細胞測序助力基因重組圖譜
來自斯坦福大學醫學院等處的研究人員發表了題為“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章，首次公布了來自一個成人男子91個
高通量測序
高通量測序技術又稱“下一代”測序技術，以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序包括：大規模平行簽名測序、聚合酶克隆、454焦磷酸測序、離子半導體測序和DNA 納米球測序等技術。 高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條DN
PNAS：單細胞測序繪制大腦的細胞圖譜
斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其同事本周在《美國科學院院刊》（PNAS）上發表文章，介紹了人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果。 研究小組對近500個成人或胎兒腦細胞進行了單細胞RNA測序。利用這種方法，他們能夠鑒定出大腦中所有主要的細胞類型，并確定神經元的亞型。他們還觀察了
高通量測序技術
沒有測序的癌癥診斷是不完整的，完整的癌癥診斷應該包括一系列基于細胞遺傳學技術、熒光原位雜交技術、標準分子技術以及NGS的預后與預測性分析。對于早期癌癥患者來說，NGS序列分析在多種癌癥的篩查技術中具有不容忽視的代表性;而對于晚期癌癥患者，大量的侵入性測試往往只能篩查出少數幾個藥物靶點。 隨
高通量測序原理
高通量測序原理是將基因組 DNA 片斷化，然后克隆到質粒載體上，再轉化大腸桿菌。對于每個測序反應，挑出單克隆，并純化質粒 DNA。高通量是相對于第一代測序的，第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列，產生的數據量相對來說很小，而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G，可以一次測很多的樣本。高通量
高通量測序原理
高通量測序原理是將基因組 DNA 片斷化，然后克隆到質粒載體上，再轉化大腸桿菌。對于每個測序反應，挑出單克隆，并純化質粒 DNA。高通量是相對于第一代測序的，第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列，產生的數據量相對來說很小，而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G，可以一次測很多的樣本。高通量
高通量測序原理
高通量測序原理是將基因組 DNA 片斷化，然后克隆到質粒載體上，再轉化大腸桿菌。對于每個測序反應，挑出單克隆，并純化質粒 DNA。高通量是相對于第一代測序的，第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列，產生的數據量相對來說很小，而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G，可以一次測很多的樣本。高通量
單細胞多組學高通量測序平臺（一）
一單細胞多組學高通量測序技術簡介通過測序手段檢測細胞多層次信息，如基因組、表觀組、轉錄組甚至蛋白組已經成為生物學研究的重要手段。幾乎一切生命體的活動都圍繞著DNA->RNA->蛋白質的過程，而現有的組學技術也圍繞這一過程獲取信息（如DNA層面的基因序列），從而解讀生物體運行機制，應用于疾病的診斷和治
單細胞多組學高通量測序平臺（二）
雖然single-cell sequencing的方法仍在不斷推出，但是目前使用最為廣泛、商業化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系統。1.2以RNA-seq為例介紹高通量單細胞測序技術單細胞測序的最主要難點是如何在短時間內分離得到最可能多的單個細胞，早期的技術代表F
《Cell》第一張靈長類視網膜細胞圖譜
幾十年來，科學家一直把普通實驗鼠的視網膜作為研究模型來理解神經元如何連接到大腦中形成回路，但是作為視覺和視覺相關疾病模型，鼠類不可謂稱職。 分子和細胞生物學教授、腦科學中心主任Joshua Sanes說，問題在于它們缺乏中央凹（fovea）——視網膜中一個很小的專門區域，形成清晰的中央視覺。在
Cell：單細胞測序繪制骨髓基質細胞全景圖譜
最新發布在Cell上的一項研究表明，單細胞測序可以繪制骨髓基質細胞的完整類群，并為白血病研究提供新的視角。這一新研究由美國哈佛大學的David T. Scadden教授和馬薩諸塞州綜合醫院Broad研究所的Aviv Regev團隊合作而成。他們創新地使用單細胞RNA測序（scRNA-seq）技術
PNAS：高通量測序揭示B細胞的生死抉擇
作為機體免疫應答的中堅力量，B細胞時刻準備著識別和摧毀入侵機體的抗原（包括感染和癌細胞）。為了做好這項工作，每一個新生B細胞都配備了高度特異性的武器——與抗原特定部分選擇性結合的抗體蛋白。B細胞的成熟要經過仔細的篩選，要么被選中得以成熟，要么被淘汰而死去。這一過程的關鍵在于，決定B細胞特異性的抗
單細胞測序這樣的高通量技術的優勢
單細胞全基因組測序主要應用于腫瘤發生機制及胚胎發育研究。單細胞轉錄組分析可以在全基因組范圍內挖掘基因調節網絡，尤其適用于存在高度異質性的干細胞及胚胎發育早期的細胞群體。2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Sin
高通量單細胞轉錄組測序發展與展望
單細胞轉錄組測序技術這幾年的發展之快，運用之廣已眾所周知。為更好的在國內推廣該技術，也為更好的將該技術運用到廣大科研工作者的實際工作中，上海生物芯片有限公司生物信息團隊通過對該技術的整理和歸納，在《生命科學》雜志上發表了名為“高通量單細胞轉錄組測序發展與展望”綜述文章，希望能進一步提升科研工作者對該
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titanium第二代
高通量測序的意義
高通量測序技術的誕生可以說是基因組學研究領域一個具有里程碑意義的事件。該技術使得核酸測序的單堿基成本與第一代測序技術相比急劇下降, 以人類基因組測序為例, 上世紀末進行的人類基因組計劃花費 30 億美元解碼了人類生命密碼, 而第二代測序使得人類基因組測序已進入萬(美)元基因組時代。如此低廉的單堿
高通量測序的步驟
當然，首先地提取出您想要測序的東西，比如RNA、DNA 。再就是建庫-測序-分析。建庫需要將序列片段化、加接頭、PCR。不同的業務有細微的差別，比如RNA要先反轉錄成cDNA等等。然后就是上機測序了！最后就是數據分析了。數據分析分為流程分析（基本分析）和個性分析（根據老師課題分析）。這些以后呢，就是
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
高通量測序技術包括
高通量測序技術及原理介紹如下：高通量測序技術（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測序技術（“Next-generation” sequencing technology），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。測序技術推進科學研
Solexa高通量測序方法
高通量測序發展的背景基因決定了一個人的相貌、身高甚至疾病，它存在于每個人體細胞的ＤＮＡ中。而組成ＤＮＡ的基本物質則是由Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｃ表示的４種堿基，一個人的基因組測序就是排列出其ＤＮＡ上所有堿基的順序。如果每個人都能擁有一份屬于自己的基因組圖譜，那么科學家們長期以來期待的“個性化醫療時代”就會可能成
什么是高通量測序
高通量測序技術（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測序技術（"Next-generation" sequencing technology），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等，主要
單細胞RNA測序發現新視網膜神經節細胞亞型
單細胞測序技術填補了生命科學領域的許多空白，依靠這項技術，康涅狄格大學健康中心和杰克遜實驗室（JAX）的研究人員已經鑒定出了40種視網膜神經節細胞（retinal ganglion cells，RGCs）亞型，以及用于區分它們的遺傳標記和轉錄因子。 得益于液滴單細胞RNA測序技術（drople
單細胞RNA測序發現新視網膜神經節細胞亞型
單細胞測序技術填補了生命科學領域的許多空白，依靠這項技術，康涅狄格大學健康中心和杰克遜實驗室（JAX）的研究人員已經鑒定出了40種視網膜神經節細胞（retinal ganglion cells，RGCs）亞型，以及用于區分它們的遺傳標記和轉錄因子。 得益于液滴單細胞RNA測序技術（drople
單細胞測序揭示肺癌腫瘤免疫細胞亞型的細胞圖譜
最近免疫療法的出現標志著多種癌癥的研究和護理發生了巨大變化，給世界各地的患者和家庭帶來了新的希望。對于那些對治療有反應的人來說，結果可能是激動人心的。激活病人的癌癥免疫系統可以殺死或縮小腫瘤，在某些情況下，會導致完全緩解。 盡管取得了重大進展，但只有少數人從免疫治療中獲益，原因尚不清楚。 免
Nature重磅！利用單細胞RNA測序構建人類肝臟細胞圖譜
肝臟是人體最大、功能最多的器官之一，在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是，肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%，就能夠完全再生的內臟器官。另外，包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一，也是導致死亡的主要原因。 盡管肝臟對人類健康極為重要，但健康
基于單細胞測序繪制腫瘤微環境相關細胞代謝圖譜
腫瘤作為一個異常復雜的“生態系統”，不同類型的腫瘤細胞與非腫瘤細胞共同構成了腫瘤微環境。腫瘤存在腫瘤間異質性和腫瘤內異質性，可以說腫瘤內每種細胞都存在于不同的微環境中，每種細胞都可能有不同的代謝狀態。由于異質性，腫瘤細胞會通過改變自身代謝模式（即“代謝重編程”）來適應不同的微環境，以滿足其對能量
Nature重磅！利用單細胞RNA測序構建人類肝臟細胞圖譜
肝臟是人體最大、功能最多的器官之一，在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是，肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%，就能夠完全再生的內臟器官。另外，包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一，也是導致死亡的主要原因。 盡管肝臟對人類健康極為重要，但健康