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  • 數字PCR在病毒臨床檢測中的應用

    概述2015年剛成歷史,2016年已在眼前。就這樣,年復一年間滄海成桑田。生命科學領域,新方法層出不窮,老方法不斷升級,好不熱鬧。也如孔子的感嘆:逝者如斯夫,不舍晝夜。就拿PCR技術來說,熒光定量PCR作為一種進行基因表達分析的技術,截至目前最大的應用市場是病原微生物的核酸體外診斷。展望未來,作為qPCR升級版的數字PCR,最大的應用市場必然將轉變成腫瘤相關的液態活檢,對此陳斯卡堅信不疑。那么,數字PCR在病原微生物的核酸體外診斷方面,是否仍然存在機會?是否在某些方面具有更出色的表現?對于《Lennette's Laboratory Diagnosis of Viral Infections第四版》的編輯Keith R. Jerome而言,答案是肯定的。2013年1月他就撰文,顯然看好數字PCR在病毒檢測中的應用前景,但2013年年初時,來自學術界一線的數據還較少,所以那篇綜述可以理解為僅僅是他個人的看好。一年后......閱讀全文

    數字PCR在病毒臨床檢測中的應用

    概述2015年剛成歷史,2016年已在眼前。就這樣,年復一年間滄海成桑田。生命科學領域,新方法層出不窮,老方法不斷升級,好不熱鬧。也如孔子的感嘆:逝者如斯夫,不舍晝夜。就拿PCR技術來說,熒光定量PCR作為一種進行基因表達分析的技術,截至目前最大的應用市場是病原微生物的核酸體外診斷。展望未來,作為q

    數字PCR在臨床和預后融合基因檢測的應用

    眾所周知,融合基因檢測對臨床診斷及預后指導都具有十分重要的意義。那么究竟什么是融合基因呢?融合基因的發現始于上個世紀60年代,它是指染色體斷裂后又重新拼接。如果恰巧拼接時發生了錯誤,使兩個不同基因互相融合,大多數情況下,它會造成某些序列或功能異常的蛋白表達,亦或者是某些基因表達失調,從而促進腫瘤的發

    微滴芯片數字PCR技術在檢測新冠病毒的應用

    國家衛健委發布了《新型冠狀病毒肺炎防控方案(第五版)》,其中在實驗室檢測技術指南中明確提出,核酸檢測結果陰性不能排除新型冠狀病毒感染。3月4日,國家衛健委發布的《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第七版)》 中提到了以下兩點:對疑似病例要盡可能采取包括快速抗原檢測和多重PCR核酸檢測等方法對呼吸道病

    數字PCR在轉基因食品或成分檢測中的應用

    ?目前在確定轉基因作物或成分的含量時采取定量PCR的標準曲線法,這種方法需要依賴于已知濃度的標準品(Certified Reference Materials Calibrants, CRMCs)。ddPCR絕對定量的方式可以徹底解決這些標準物質的定標工作,從而確保安全和品質。

    數字PCR技術在DNA甲基化檢測中的應用

    DNA甲基化是目前研究最多的表觀遺傳修飾之一,發生于CpG二核苷酸序列C5位置的胞嘧啶上,多發生于CpG島上,研究發現,DNA甲基化參與調節多種細胞過程,包括胚胎發育,轉錄,X染色體失活,基因組印跡、染色體穩定性等。許多研究發現,DNA甲基化在一系列的疾病(如癌癥等)起到十分重要的作用。在癌癥患者中

    數字PCR在移植排斥監控中的應用

    為了降低器官移植中移植物排斥導致的風險,數字PCR技術通過監測受體中移植器官供體的循環DNA水平來檢測早期移植排斥。

    數字PCR在致病微生物(病毒、細菌等)的檢測的應用

    疾病預防控制中心、出入境檢驗檢疫局系統的實驗室可以將基于TaqMan探針法的定量PCR體系無縫地轉移到數字PCR上,從而滿足該類實驗室對于檢測結果的要求:靈敏度更高、重復性更好、無需依賴標準曲線的絕對定量結果,同時操作簡便。

    數字PCR在食品安全檢測的應用

    食品安全日益成為一個重要的公共衛生問題, 受到社會及國家的高度重視。食源性疾病、食品原料造假、轉基因食品等逐漸呈現出普遍增長的趨勢。食源性疾病是指通過攝食而進入人體的有毒有害物質等致病因子所造成的疾病。比如常見的食物中毒、腸道傳染病、人畜共患傳染病、寄生蟲病等。食源性疾患的發病率居各類疾病總發病率的

    數字PCR在腫瘤的液體活檢中的應用

    ?腫瘤學研究是數字PCR的重要應用領域,該技術作為極為重要的工具,能夠識別DNA突變(例如EGFR)、腫瘤患者用藥監控、基因擴增檢測、循環腫瘤細胞(CTC)特性研究、長鏈非編碼RNA檢測、液體活檢中循環的核酸(cfDNA)和腫瘤細胞(CTC)的絕對定量等研究中。

    數字PCR和HRM在腫瘤樣本中的應用

    摘要:Vogelstein和Kinzler(美國國家科學院院刊,1999年)第一次描述了Digital PCR(dPCR)的概念,一種在微量細胞群中(如原發性腫瘤組織)鑒定突變的方法。通過稀釋樣品DNA到一個單個分子水平,它可以把PCR自然模擬指數轉化為數字信號。當PCR成功的擴增出這些單個

    數字PCR在糖尿病治療中的應用

    ? ? 數字PCR技術目前在糖尿病中的研究熱點,通過定量檢測非甲基化DNA的水平,對I型糖尿病β細胞死亡進行定量,從而監控病情發展。

    Nacia數字PCR在基因表達分析中的應用

    華盛頓大學醫學院兒科和加利福尼亞大學圣地亞哥分校醫學院兒科的研究人員建立了一個穩定可靠的基于RNA磁珠提取和數字PCR的方法,可從糞便樣本中檢測與EE(熱帶腸病)關聯的人mRNA,靈敏度可達20拷貝GAPDH mRNA/200mg糞便樣本。已有報道表明病人糞便中存在人mRNA,可作為反應病人消化道病

    血漿中ctDNA甲基化數字PCR檢測攻略Naica數字PCR的應用

    基因調控區的DNA甲基化狀態的改變可導致多種癌癥的發生。這種表觀遺傳學改變在生物學上是穩定的,并存在于循環腫瘤DNA(ctDNA)中,使其適合于早期檢測和無創動態監測腫瘤負荷。數字PCR技術憑借其較高的靈敏度、精準度以及對抑制劑的耐受度,在對低拷貝樣品檢測時表現出了極大的優勢。在轉移性和II/III

    數字PCR在-藥物基因組檢測的應用

    ? 能夠通過PCR技術實現藥物基因組的檢測,提高合理用藥水平,具有通量較高,操作簡單,儀器設備易普及等優點。? ? 數字PCR冷知識:胎兒性別不是只有B超可以看出來,一只精通數字PCR的科研狗,也可以測出來。

    PCR在臨床檢驗中的應用(二)

    ???? 呼吸系統感染性疾病主要的有肺結核、非典型性肺炎等。結核桿菌感染曾給人類健康帶來很大威脅,一度是較嚴重的致死性疾病之一。解放以后由于對結核病的預防的重視,特別是特效抗癆藥物的出現,使結核病流行基本被控制。近來結核病有抬頭的趨勢,基原因可能有兩方面,其一是耐藥株的不斷出現,其二是對結核預防

    PCR在臨床檢驗中的應用(三)

    ??? ?我國惡性腫瘤為人口死亡的第一位原因,其中以肺癌、胃癌及食管癌的發病率最高,占惡性腫瘤死亡總數的60%以上。引起腫瘤的原因非常復雜包括外界環境因素及遺傳背景。外界因此可分為三大類即化學、物理及生物因素。腫瘤與遺傳有關的證據越來越多,除已知的單基因遺傳腫瘤如視網膜細胞瘤、腎母細胞瘤等以外,

    PCR在臨床檢驗中的應用(一)

    醫學檢驗大致可分為形態學、生物化學、血清免疫學和分子生物學幾大類,其分別代表幾代實驗診斷技術。60年代DNA雙螺旋結構及半保留復制模式的出現,70年代基因重組及體外基因克隆技術、分子雜交技術的應用使分子生物學在疾病診斷中得到了長足的發展。特別是1985年Mullis發明了聚合酶鏈式反應(PCR)技術

    PCR在臨床檢驗中的應用(四)

    遺傳病是由于遺傳基礎異常而引起的疾病,人類遺傳病約有3000多種,患者占總人口數的10%。遺傳病大概可分為單基因、多基因及染色體遺傳病。常用診斷方法有家系譜分析、染色體檢查(特別是顯帶法)、生物化分析等。隨分子生物學發展,基因診斷愈來愈表現出其優越性,PCR技術是基因診斷的主要技術之一,為快速、準確

    數字PCR在傳染性疾病的檢測的應用

    ?數字PCR技術因起高精密度、耐受能力強、高靈敏度等優點,逐漸被用于病毒載量分析的相關研究。如HIV抗逆轉錄病毒治療過程中病毒殘留量的監控;HBV耐藥突變的檢測;HCV的分子分型;抗甲氧西林金黃色葡萄球菌的院內感染監控;環境微生物不同功能基因之間的連鎖分析等等。

    PCR檢測輸血傳播病毒DNA的臨床應用

    在急慢性輸血后肝炎、散發性肝炎、急性重型肝炎及肝硬化病例中,有部分病例無法用已建立的甲、乙、丙、丁、戊型肝炎的實驗室診斷方法進行病原學分型。繼1995年發現庚型肝炎病毒(HGV)后,1997年日本學者Nishizawa等[1]報道了應用代表性分析法發現了一種可能與輸血后肝炎相關的病毒,暫時稱為輸血傳

    數字PCR在環境監測的應用

    ?基因目標的環境監測,需要對復雜樣品中低濃度的目標進行準確檢測。ddPCR每次運行中能創建數千個PCR反應室,帶來了目標的準確測定,即使它們濃度很低,因此可以實現對土壤、污水、淤泥、酒泥等為樣本的環境生物學研究和病原微生物監測。

    數字PCR在-癌癥標志物稀有突變檢測的應用

    ?在一份給定的樣本中,相比于野生型DNA,癌癥相關的突變序列比例較低,經常無法檢測。而憑借其超高靈敏度,dPCR系統可以很容易地定量分析低至0.001%-0.0001%的突變頻率。之前用任何方法都無法實現準確穩定檢測的樣本,現在可以使用dPCR輕松進行定量分析。例如,已實現肺癌相關的表皮生長因子受體

    PCR技術在突變基因檢測中的應用

    基因突變(gene mutation)是遺傳病和腫瘤發生的根本原因,檢測與遺傳病及惡 性腫瘤發生有關的突變基因(mutant gene)是分子生物學,醫學遺傳學及腫瘤學研究 的熱點,它對闡明遺傳病和腫瘤發生的分子生物學基礎及其診斷和早期診斷具有重要 \意義,分子生物學技術的發展,尤其是PCR技術的出

    PCR技術及其在臨床診斷應用中的進展

    一、病原體的定性及定量檢測,PCR及其相關技術適用于病毒,細菌、寄生蟲等所有病原體的檢測,以下就SDA首批的四種病原體基因診斷項目加以說明。1. PCR技術在結核菌檢測中的應用及意義結核菌基因診斷的意義主要表現在:a. 區分TB與其它分枝桿菌;b. 檢測TB耐藥基因;c . 提高TB的陽性檢出率。2

    數字PCR在癌癥早篩和微小殘留病灶檢測的應用

    最近幾十年的大量研究表明,在許多血液系統惡性腫瘤中,微小殘留病灶(MRD)與臨床結果及預后顯著相關。癌癥中MRD是指癌癥治療達到完全緩解后,用常規的形態學檢測方法不能檢測到明顯的癌病灶,而此時體內仍存在的少量癌細胞。微小殘留病灶是腫瘤復發的直接原因。目前應用最廣泛最精確的MRD檢測手段是通過取患者的

    數字PCR在基因型鑒定的應用

    PCR也可以用于檢測一個生物中是否存在某特定DNA序列,這被稱為基因型鑒定。例如,基因型鑒定可通過發現樣品中是否存在某種群特異性序列來判斷樣本的真實性。基因型鑒定還可用于法醫分析判斷在現場發現的DNA樣品是否和嫌疑人的吻合,令兇手無處遁形。

    數字PCR在早期精準檢驗疫情的應用

    ? 2016年,全球首例數字PCR動物疫病檢測試劑研發成功,包括禽流感、禽流感H7N9、藍耳病、高致病性美州株、豬的流行性腹瀉等動物疫病檢測試劑盒。此項技術的推出,將有助于在食品安全的源頭及早發現疫情,盡早處理避免更大面積的傳染,更好地控制漏檢,減少傳染人的幾率;也將有助于國家建立規范化、規模化的動

    數字PCR在基因表達差異研究的應用

    數字PCR由于檢測時完全不依賴傳統的Ct值即可實現真正意義上的絕對定量,因而可以提供比實時熒光定量PCR更精確的基因差異表達研究,尤其對于那些靶基因表達差異微小的情況,如:mRNA、microRNA、lncRNAs等的表達分析;等位基因的不平衡表達;單細胞基因表達分析;外泌體核酸分子定量分析等。

    數字PCR在腸道菌群分析的應用

    數字PCR技術直接計算目的序列的拷貝數,對樣品中的微生物實現了絕對定量,可用于微生物檢測,以便進一步研究腸道菌群的結構、功能以及數量。

    PCR快速檢測技術及其在食品中的應用

       [摘 要] 微生物食品安全是當前消費者與食品工業共同關注的話題,食品中致病菌的快速、準確、簡便檢測,對于食品安全質量控制以及食品鏈中致病性細菌的溯源追蹤具有重要作用。在選用微生物的快速檢測方法時,應該考慮到方法的預期目標的精確性、檢測時間、經濟性、可接受性、操作簡便性、技術服務等因素。介紹了P

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