解鎖5分m6A甲基化譜文章新思路
1.構建OSC細胞模型--MG63/DXR作者選擇人的OS細胞系--MG63,通過阿霉素DXR誘導,建立了多藥耐藥性細胞株--MG63 / DXR。并通過分析其特定的細胞表面標志物CD133和CD117 / STRO-1;干細胞相關基因的表達量;皮下注射對裸鼠的致瘤潛力等多個方面數據證明MG63 / DXR具有OSC的特性。圖1 MG63 / DXR具有OSC的特性2.OSC中mRNA上m6A甲基化修飾的整體概況作者首先挑選了四個與m6A甲基化相關的主要酶,包括METTL3、METTL14、FTO和ALKBH5,從RNA和蛋白水平檢測了它們在MG63 / DXR和MG63中的表達,發現METTL3和ALKBH5在MG63 / DXR中顯著性上調。因此推測在OSC和非OSC細胞系之間可能存在m6A甲基化的差異,于是后期通過m6A MeRIP-seq(云序生物提供此項服務)進行進一步檢測。圖2 m6A甲基化......閱讀全文
解鎖5分m6A甲基化譜文章新思路
1.構建OSC細胞模型--MG63/DXR作者選擇人的OS細胞系--MG63,通過阿霉素DXR誘導,建立了多藥耐藥性細胞株--MG63 / DXR。并通過分析其特定的細胞表面標志物CD133和CD117 / STRO-1;干細胞相關基因的表達量;皮下注射對裸鼠的致瘤潛力等多個方面數據證明MG
2019年云序RNA甲基化修飾領域文章匯總
感恩有你,一路同行!2019年末,云序生物攜全體員工對一直以來關心和支持公司發展的廣大新老客戶致以最誠摯的問候!光陰如梭,一年轉瞬又將成為歷史,新的一年意味著新的起點、新的機遇、新的挑戰,決心再接再厲,更上一層樓。回首即將過去的2019,云序生物不斷創新,碩果累累;展望2020,任重道遠卻信心倍
三個月內搞定5分m6A甲基化譜文章
關于m6A修飾的研究在生物領域持續火熱,近年國自然立項和文章發表數目保持指數增長趨勢,2020年pubmed收錄文章已經高達652篇。云序生物在m6A修飾測序領域具有豐富的經驗,近期云序客戶又連發了5篇m6A甲基化測序研究的文章,下面小編就帶大家一起來分析下這幾篇發表文章的研究思路,給想短時間內發表
揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間,染色體外環狀DNA(eccDNA)重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊,這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖,吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增,極大地促進腫瘤
甲基化研究新思路
????????組蛋白甲基化研究與表觀調控是腫瘤機制研究中的重要方向,然而傳統甲基化研究一般分四步走:尋找甲基化位點、分析甲基化位點與生物表型相關性、驗證甲基化調控靶基因表達量變化、構建轉錄層面調控機制。為更深入探索表觀調控與臨床現象間的具體機制,上海華盈生物合作伙伴——華中科技大學同濟醫院馬丁院士
Nature-Genetics-揭示eccDNA功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間,染色體外環狀DNA(eccDNA)重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊,這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖,吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增,極大地促進腫瘤
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用
最近小編檢索了關于m6A修飾的文章發表情況,發現目前2020年發表的關于m6A修飾的文章已經達到309篇,已經追平2019年整年度發表篇數,可以預見m6A RNA修飾下半年年發表文章會呈現出爆炸式增長。 圖1. 近6年m6A RNA修飾相關文章發表情況( data from PubMe
5篇m6A甲基化文章教你如何使用純測序數據
文章導讀2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子文章佳話。2020年1月17日何川教授團隊最新Science揭示了m6A新功能---調控染色質狀態和轉錄預示m6A等RNA修飾將仍然是目前最為熱門的科研方向。m6A甲基化與mRNA關聯分析案例一:非洲爪蟾睪丸組織中m6A甲基化圖譜發表
m6A文章盤點(二)
是不是甲基化一定發生在mRNA的3’UTR區域才能有重要作用呢?在這篇Nature Communication文章當中的故事則有所不同。上皮間質轉換(epithelial-mesenchymal transition)是癌細胞轉移的重要步驟,在這一過程當中發現mRNA的m6A水平會有所升高,
m6A文章盤點(一)
19年悄悄的已經將近過半,但RNA甲基化研究馬不停歇。單單過去一個半月的時間里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相關文章發表;造血干細胞分化,癌細胞上皮間質轉化,樹突細胞活化,心肌細胞肥厚,內源性免疫應答調控都有它的身影。這里小編給大家列舉展示幾篇最新的m6A RNA甲基化研究成
云序生物最新“RNA-甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上頻頻亮相,并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者,許多學者將它作為研究對象,并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合,證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期,
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用(一)
導讀最近小編檢索了關于m6A修飾的文章發表情況,發現目前2020年發表的關于m6A修飾的文章已經達到309篇,已經追平2019年整年度發表篇數,可以預見m6A RNA修飾下半年年發表文章會呈現出爆炸式增長。?圖1. 近6年m6A RNA修飾相關文章發表情況( data from PubMed)那么您
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用(二)
為了進一步說明Mettl3在CRC糖酵解過程中促進腫瘤發展的作用,作者通過RNA-seq(云序可提供此服務)分析比較Mettl3 KO和野生型的細胞(WT HCT116 CRC)基因表達情況。通過GO和KEGG分析,WT HCT116主要富集與葡萄糖代謝相關的信號通路,而Mettl3 K
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用(三)
(5)酶METTL3作用分子機制研究已表明Mettl3是一種甲基化轉移酶,可以調控靶分子的甲基化水平,那么是如何調節糖代謝過程呢?現有實驗已表明Mettl3敲除或過表達不僅影響HK2和SLC2A1的甲基化水平,還調節HK2和SLC2A1的表達水平,這暗示著靶分子甲基化水平影響其表達,而雙熒光素酶實驗
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用(四)
1)m6A修飾PCR芯片?new!云序生物提供m6A修飾PCR芯片檢測,高效一次性檢測m6A相關的Writer,Eraser,Reader的表達情況,m6A PCR 芯片基因列表(34 個基因)-human如圖:??2)RNA修飾PCR芯片?new!云序生物提供多種RNA修飾PCR芯片檢測,高效一次
“RNA-甲基化”研究匯總——擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上頻頻亮相,并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者,許多學者將它作為研究對象,并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合,證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育
云序生物最新“RNA-甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上頻頻亮相,并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者,許多學者將它作為研究對象,并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合,證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期,
睪丸間質細胞(LCs)m6A修飾提供新治療靶點在不育癥...3
總結:?細胞的生長與分化依賴于基因的調控表達方式,越來越多的研究表明m6A 甲基化在更多領域發揮著關鍵作用,而本文作者正是利用多組學MeRIP,?RIP,?CoIP,?CHIP(云序生物提供此服務)等多種技術聯合分析,揭示了m6A修飾通過影響Camkk2轉錄的穩定性和Ppm1a的翻譯效率調節LC
云序超微量MeRIP測序技術在m6A甲基化文章發表的應用1
m6A甲基化是近年來一大熱門研究方向,種種研究表明m6A修飾在各種真核生物、各類組織細胞中普遍存在,并對多種生物學功能、疾病腫瘤的發生發展具有極大影響。m6A甲基化位點的檢測依賴于MeRIP-seq,其中的抗體免疫共沉淀(IP)環節要求樣品RNA起始量相較普通轉錄組測序要高,曾經令許多難以大量獲取的
5篇m6A甲基化文章教你如何使用純測序數據得高分
文章導讀 2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子文章佳話。2020年1月17日何川教授團隊最新Science揭示了m6A新功能---調控染色質狀態和轉錄預示m6A等RNA修飾將仍然是目前最為熱門的科研方向。 云序生物是國內最早提供m6A測序的科研平臺,也是客戶發表
5篇m6A甲基化文章教你如何使用純測序數據得高分
2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子文章佳話。2020年1月17日何川教授團隊最新Science揭示了m6A新功能---調控染色質狀態和轉錄預示m6A等RNA修飾將仍然是目前最為熱門的科研方向。 云序生物是國內最早提供m6A測序的科研平臺,也是客戶發表文章最多的RNA甲基化測
2019年,大牛們都在研究什么?—m6A文章盤點
19年悄悄的已經將近過半,但RNA甲基化研究馬不停歇。單單過去一個半月的時間里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相關文章發表;造血干細胞分化,癌細胞上皮間質轉化,樹突細胞活化,心肌細胞肥厚,內源性免疫應答調控都有它的身影。這里小編給大家列舉展示幾篇最新的m6A RNA甲基化研究成
小白必看!RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
RNA甲基化(RNA methylation)是一類表觀遺傳修飾,在已經發現的超過100種不同的RNA化學修飾中,主要有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)、5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine, m5C)和1-甲基腺嘌呤(N1-methyladenos
2019年,大牛們都在研究什么?—m6A文章盤點
19年悄悄的已經將近過半,但RNA甲基化研究馬不停歇。單單過去一個半月的時間里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相關文章發表;造血干細胞分化,癌細胞上皮間質轉化,樹突細胞活化,心肌細胞肥厚,內源性免疫應答調控都有它的身影。這里小編給大家列舉展示幾篇最新的m6A RNA甲基化研究成
云序超微量MeRIP測序技術在m6A甲基化文章發表的應用2
3) m6A修飾與基因表達聯合分析通過m6A-MeRIP-seq和RNA-seq聯合分析,文章展示了m6A修飾水平與基因表達水平間的關系,統計發現表達高的基因分組中,受m6A修飾的基因比例也更高。4)甲基化相關酶的表達通過qPCR檢測了兩組樣品中6個甲基化相關酶的表達,發現在高度近視白內障患者中甲基
SMAD2/3與TGFβ影響轉錄因子發生m6ARNA甲基化調控干細胞發育
文章導讀: 胚胎干細胞作為一種全能性細胞,通過增殖和分化,產生動物體所有組織和器官的細胞。已有研究表明,胚胎干細胞發生m6A RNA甲基化,大多與細胞增殖[1-2],免疫應答[4]關系密切。然而,對于m6A修飾在胚胎干細胞向神經內胚層細胞分化過程中的分子機制目前并沒有相關報道。今天,分享一
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點,也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature,cell級別高分文章領域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼,之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究(詳細見云序課堂之前往期回顧)。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RN
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆襲為今天新星
m6A RNA甲基化是當前在LncRNA,環狀RNA等非編碼RNA之后最為火熱的科研明星,到底有多火?擺出數據告訴你! 2019年才過去一半還不到,已發表文章數就已占去年的7成。RNA甲基化領域,不僅文章數量多,高分文章也有許多。據統計,僅2019年上半年就發表了多篇Nature,Cell
RNA甲基化研究深度剖析(一)
一、聽說最近?RNA甲基化很火,它是何方神圣?1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點,RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一,亮點文章頻出,著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的,就有高達?17?篇。 圖:RNA甲基化近期高
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點,也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature,cell級別高分文章領域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼,之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究(詳細見云序課堂之前往期回顧)。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RN