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  • 高通量測序

    高通量測序技術又稱“下一代”測序技術,以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序包括:大規模平行簽名測序、聚合酶克隆、454焦磷酸測序、離子半導體測序和DNA 納米球測序等技術。 高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序。......閱讀全文

    高通量測序技術-中的“高通量”-是什么意思

    高通量是相對于第一代測序的,第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列,產生的數據量相對來說很小,而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G,可以一次測很多的樣本。在2000年的時候,3700、MegaBace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。不過到2005年以后,高通

    高通量測序技術——第二代測序技術

    高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(de

    基因組高通量測序的原理

    測序方案建立在雙脫氧測序法(Sanger等,1977)的基礎上。為了從每一克隆插入片段兩端成對地進行測序,每一個質粒模板DNA板應配備兩個384孔循環測序反應板。測序反應采用Big Dye Terminator chemistry version 3.1(AppliedBiosystems)和標準M

    高通量測序-鎖定病原體“命門”

      病原體能使人類群體性致病甚至致死,為追本溯源,找到變異基因作為有效靶點,科學家們在迎戰埃博拉病毒的過程中取得突破。  《科學》雜志的歷史上,刊載過一篇沉重的學術文章。2014年一篇關于通過基因組學手段監測埃博拉病毒的起源和傳播的論文,在刊登時已有6名研究人員因感染埃博拉而死亡。  “對埃博拉病毒

    llumina高通量測序平臺的應用(二)

    3、可逆化學阻斷技術測序??????? 利用邊合成邊測序(Sequencing?by?synthesis)的原理,加入改造過的DNA聚合酶和帶有4種熒光標記的dNTP。這些核苷酸是“可逆終止子”,因為3’羥基末端帶有可化學切割的部分,每個循環它只容許摻入單個堿基。去除其他多余的dNTP后,用激光掃描

    高通量測序--鎖定病原體“命門”

    《科學》雜志的歷史上,刊載過一篇沉重的學術文章。2014年一篇關于通過基因組學手段監測埃博拉病毒的起源和傳播的論文,在刊登時已有6名研究人員因感染埃博拉而死亡。“對埃博拉病毒的研究和控制是高通量測序技術(二代測序技術)全面應用的首次‘實戰’。”日前,在由中國醫學科學院、北京協和醫學院主辦的第

    高通量測序的技術應用的介紹

      測序技術推進科學研究的發展。隨著第二代測序技術的迅猛發展,科學界也開始越來越多地應用第二代測序技術來解決生物學問題。比如在基因組水平上對還沒有參考序列的物種進行從頭測序(de novosequencing),獲得該物種的參考序列,為后續研究和分子育種奠定基礎;對有參考序列的物種,進行全基因組重測

    遺傳病家系的高通量測序

    摘要 高通量測序技術的出現與普及,為遺傳病的研究帶來了前所未有的機會。它提高了遺傳病致病基因克隆和鑒定的效率,使人類對自身基因功能的認識大大加速。本文對遺傳病家系的高通量測序分析提出一些注意事項,希望有助于相關的研究。 前言 我國是一個多民族的人口大國,也是遺傳病家系資源比較豐富的國家之一。遺傳病家

    llumina高通量測序平臺的應用(一)

    Illumina公司的新一代測序儀Genome?Analyzer最早由Solexa公司研發,利用其ZL核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結(reversible?terminator)”,實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收購了

    高通量測序技術應用發展現狀

      根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等,主要有以下幾種:大規模平行簽名測序(MassivelyParallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony Sequencing)、454焦磷酸測序(454 pyrosequencing)、Illumina

    全外顯子測序和高通量測序一樣嗎

    能否簡述下全外顯子測序和普通的基因測試、全基因組測序有什么不同...全外顯子組測序,是指利用序列捕獲技術將只占基因組1%的外顯子進行高通量測序,從而檢測出約85%的致病突變,測序深度更高,數據更有效,變異檢測更準確。全基因組測序,是利用高通量測序平臺對一種生物的基因組中的全部基因進行測序,可以同時

    Cell:高通量測序解析神秘X失活

      來自北卡羅萊納大學遺傳學系Terry Magnuson實驗室的研究人員完成了一項最新研究成果,拓寬了我們對于一個特殊的過程:X去活性(X inactivation)的理解,有助于更深入了解細胞如何調控這一過程中的X染色體沉默。相關成果公布在11月21日的Cell雜志上。   文章的第一作者

    2015年或成高通量測序應用大年!

      如果說2014年是二代測序的元年,那么2015年將是一個大年。我們將2014年稱為元年,是因為在過去的這一年里監管層出臺了一些列政策,規范行業,并刻畫出未來行業發展的方向和走勢。本文是對IVD行業運行情況跟蹤,筆者預測2015年或成高通量測序應用大年!   1、本期核心觀點:2015年

    高通量測序技術技術的應用及前景

      高通量測序技術技術的應用及前景   (作者:生物芯片上海國家工程研究中心 滕曉坤, 肖華勝)   高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變, 一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定, 因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃

    單細胞多組學高通量測序平臺(一)

    一單細胞多組學高通量測序技術簡介通過測序手段檢測細胞多層次信息,如基因組、表觀組、轉錄組甚至蛋白組已經成為生物學研究的重要手段。幾乎一切生命體的活動都圍繞著DNA->RNA->蛋白質的過程,而現有的組學技術也圍繞這一過程獲取信息(如DNA層面的基因序列),從而解讀生物體運行機制,應用于疾病的診斷和治

    用高通量免疫測序診斷病毒感染

    藥明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 宣布在《自然》子刊《Nature Genetics》上發表創新型研究論文,結果證明可提供一種潛在的新穎方法診斷慢性病毒感染。▲藥明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 在《Nature Genetics》上

    高通量測序技術研究進展介紹

      第二代測序技術, 又稱新一代測序技術, 是相應于以Sanger 測序法為代表的第一代測序技術而得名。第二代測序中3種主流測序技術分別為依次出現的 Roche/454 焦磷酸測序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成測序(2006 年)和 ABI/SOLiD 連接酶測序(

    高通量測序技術技術的應用及前景

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    液相序列捕獲系統與高通量測序

    Nature Biotechnology 2009年2月封面文章:基于安捷倫寡核苷酸序列合成技術的液相序列捕獲系統 – 高通量平行靶向測序的最佳解決方案來自美國麻省理工學院和哈佛大學Broad研究院的研究人員,利用安捷倫(Agilent Technologies)卓越的寡核苷酸序列合成技術,合成

    高通量測序技術技術的應用及前景

    高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變, 一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定, 因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變, 同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能, 所以又被稱

    單細胞多組學高通量測序平臺(二)

    雖然single-cell sequencing的方法仍在不斷推出,但是目前使用最為廣泛、商業化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系統。1.2以RNA-seq為例介紹高通量單細胞測序技術單細胞測序的最主要難點是如何在短時間內分離得到最可能多的單個細胞,早期的技術代表F

    高通量測序中植物樣本的制備方法

    高通量測序技術已廣泛應用于植物研究中,但植物材料中較多的蛋白質、多糖以及酚、脂類等次生代謝物質,提取核酸的難度往往比動物或原核生物樣本大,因此如何從植物樣本中得到高質量的核酸進行后續的測序,成為在植物高通量測序應用中的首要因素。根據核酸類型,可有如下制備方法可參考: 1. 植物基因組 DNA

    高通量測序平臺及其性能參數介紹

      Roche 454、Illumina、Solexa和ABI SOLiD為主的三個測序平臺,目前最主流的二代測序平臺是 Illumina 所生產的測序儀,包括 MiSeq 系列、 HiSeq 系列、 NextSeq系列等。另外的還包括羅氏公司的 454 測序儀(目前已關閉)、華大基因的 BGI-C

    高通量測序(NGS)的過程及原理介紹

      高通量測序技術的一般過程是將DNA(或cDNA)隨機片段化,加上接頭序列,制備用于上機測序的文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號獲取序列信息,最終通過數據分析來挖掘序列中的科學問題。幾種不同測序平臺的原理及步驟如下:(1)Roche 454平臺  Roch

    高通量測序技術的兩大難點

    ?? 沒有測序的癌癥診斷是不完整的,完整的癌癥診斷應該包括一系列基于細胞遺傳學技術、熒光原位雜交技術、標準分子技術以及NGS的預后與預測性分析。對于早期癌癥患者來說,NGS序列分析在多種癌癥的篩查技術中具有不容忽視的代表性;而對于晚期癌癥患者,大量的侵入性測試往往只能篩查出少數幾個藥物靶點。  隨著

    第二代測序技術:高速發展的高通量測序技術

    高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測

    PNAS:高通量測序揭示B細胞的生死抉擇

      作為機體免疫應答的中堅力量,B細胞時刻準備著識別和摧毀入侵機體的抗原(包括感染和癌細胞)。為了做好這項工作,每一個新生B細胞都配備了高度特異性的武器——與抗原特定部分選擇性結合的抗體蛋白。B細胞的成熟要經過仔細的篩選,要么被選中得以成熟,要么被淘汰而死去。這一過程的關鍵在于,決定B細胞特異性的抗

    LSAC生命科技論壇:高通量測序技術與應用

    LSAC生命科技論壇:高通量測序技術與應用LSAC Life Science & Biotech Forum  2014 LSAC生命科技論壇:高通量測序技術與應用  會議時間:2014年9月24-26日  會議地點:上海新國際博覽中心  會議主題:高通量測序技術與應用  主辦方:生物谷 (www.

    單細胞測序這樣的高通量技術的優勢

    單細胞全基因組測序主要應用于腫瘤發生機制及胚胎發育研究。單細胞轉錄組分析可以在全基因組范圍內挖掘基因調節網絡,尤其適用于存在高度異質性的干細胞及胚胎發育早期的細胞群體。2017年6月16日,北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Sin

    高通量單細胞轉錄組測序發展與展望

    單細胞轉錄組測序技術這幾年的發展之快,運用之廣已眾所周知。為更好的在國內推廣該技術,也為更好的將該技術運用到廣大科研工作者的實際工作中,上海生物芯片有限公司生物信息團隊通過對該技術的整理和歸納,在《生命科學》雜志上發表了名為“高通量單細胞轉錄組測序發展與展望”綜述文章,希望能進一步提升科研工作者對該

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