重慶醫科大學利用lncRNA芯片和circRNA芯片來研究膀胱癌
重慶醫科大學基礎醫學院的陳俊霞教授主要從事腫瘤轉移及信號傳導方面的基礎研究。近期，該課題組和西南醫科大學田強教授課題組合作應用美國Arraystar公司的lncRNA芯片和circRNA芯片分析了膀胱癌組織的非編碼RNAs表達情況，同時篩選到一批可預測膀胱癌發生和復發的分子標志物，并闡明了lncRNA和circRNA在膀胱癌的發生和發展中可能發揮的作用。該研究成果于2016年發表在國際著名學術期刊Oncotarget(影響因子5.008)上。（芯片實驗由康成生物提供技術服務） 研究背景 膀胱癌（BC）是泌尿系統常見的惡性腫瘤之一，并且發病率在男性癌癥患者中位列第七。每年全球新增44萬膀胱癌患者，其中約有13萬因患膀胱癌而死去，而較高的復發率是膀胱癌的典型特征。近幾年，很多研究表明非編碼RNA在腫瘤的發生和發展中發揮著極其重要的作用，比如lncRNA和circRNA。但是，非編碼RNAs在膀胱癌的發展過程中具體的作用機制......閱讀全文
重慶醫科大學利用lncRNA芯片和circRNA芯片來研究膀胱癌
重慶醫科大學基礎醫學院的陳俊霞教授主要從事腫瘤轉移及信號傳導方面的基礎研究。近期，該課題組和西南醫科大學田強教授課題組合作應用美國Arraystar公司的lncRNA芯片和circRNA芯片分析了膀胱癌組織的非編碼RNAs表達情況，同時篩選到一批可預測膀胱癌發生和復發的分子標志物，并闡明了lnc
circRNA在膀胱癌中的作用機制
研究背景膀胱癌（Bladder cancer）是一種常見的泌尿系統腫瘤，由于易轉移，死亡率高，5年生存率只有8.1%。因此，研究膀胱癌的發病機制，有助于對膀胱癌的診斷和治療。circRNA是一類具有閉合環形結構的非編碼RNA，是現階段轉錄組學研究的新星。本研究從circRNA的角度出發，深入闡述
全轉錄組測序的“一箭三雕”：circRNA，lncRNA，mRNA
1. 文章主題：環狀RNA通過靶向miRNA調控的信號傳導促進結直腸癌的轉移發表期刊：Journal of pathology影響因子：5.942發表時間：201906實驗方法：全轉錄組測序實驗樣本：結直腸癌組織肝轉移是結直腸癌（CRC）患者的主要死亡原因。作者使用全轉錄組測序在CRC肝轉移的小鼠模
《EMBO－reports》上闡述circRNA在膀胱癌中的作用機制
研究背景 膀胱癌（Bladder cancer）是一種常見的泌尿系統腫瘤，由于易轉移，死亡率高，5年生存率只有8.1%。因此，研究膀胱癌的發病機制，有助于對膀胱癌的診斷和治療。circRNA是一類具有閉合環形結構的非編碼RNA，是現階段轉錄組學研究的新星。本研究從circRNA的角度出發，
為什么熒光素酶互補實驗結果陰性也有
三大類的非編碼RNA（ncRNA），miRNA/lncRNA/circRNA仍然是醫學基礎研究領域最為火熱的研究熱點，大部分的研究人員在立項之初，通過查閱文獻或二代測序+生物信息學分析，獲得了合適的研究對象，但在實驗推進的過程中卻遇到了重重困難。主要有以下幾個原因：1. 找錯了轉錄本；2. ncRN
非編碼RNA(ncRNA)在前列腺癌發生發展中的作用機制
人類基因組計劃的研究結果顯示, 僅有2.5萬~3萬個蛋白質編碼基因, 占總基因組序列不到3%, 其余基因組序列轉錄產生的RNA都是非編碼RNA(non-coding RNA, ncRNA). ncRNA與惡性腫瘤發生發展關系密切. 近年來, 關于ncRNA中的長鏈非編碼RN(lncRNA)以及環
伯豪客戶《EMBO－reports》上闡述circRNA在膀胱癌中的作用機制
研究背景 膀胱癌（Bladder cancer）是一種常見的泌尿系統腫瘤，由于易轉移，死亡率高，5年生存率只有8.1%。因此，研究膀胱癌的發病機制，有助于對膀胱癌的診斷和治療。circRNA是一類具有閉合環形結構的非編碼RNA，是現階段轉錄組學研究的新星。本研究從circRNA的角度出發，
當腫瘤遇上外泌體，會碰撞出怎樣的火花？
迄今為止，化療仍是癌癥治療中的不可或缺的重要一環。但有研究認為，一些化療藥物，在殺死癌細胞的時候，還會促進癌細胞的轉移，在這個過程中，外泌體發揮著非常關鍵的作用。洛桑聯邦理工學院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在國際知名雜志《Nature Cell
當腫瘤遇上外泌體，會碰撞出怎樣的火花
迄今為止，化療仍是癌癥治療中的不可或缺的重要一環。但有研究認為，一些化療藥物，在殺死癌細胞的時候，還會促進癌細胞的轉移，在這個過程中，外泌體發揮著非常關鍵的作用。洛桑聯邦理工學院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在國際知名雜志《Nature Cell Bi
當腫瘤遇上外泌體，會碰撞出怎樣的火花
迄今為止，化療仍是癌癥治療中的不可或缺的重要一環。但有研究認為，一些化療藥物，在殺死癌細胞的時候，還會促進癌細胞的轉移，在這個過程中，外泌體發揮著非常關鍵的作用。洛桑聯邦理工學院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在國際知名雜志《Nature Cell Bi
circRNA再發IF=18.88高分文章circRNA機制研究匯總
超強子調控circRNA-Nfix缺失誘導成年小鼠心肌梗死后再生 circRNAs正在成為心臟發育和疾病強有力的調節因子，但其在心臟再生中的作用仍然未知。鑒于此，作者與他的團隊探究了與超增強子(SEs)相關的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生過程中的功能，并探究了其調節心臟重塑的分子機制
circRNA再發IF=18.88高分文章circRNA機制研究匯總
超強子調控circRNA-Nfix缺失誘導成年小鼠心肌梗死后再生 circRNAs正在成為心臟發育和疾病強有力的調節因子，但其在心臟再生中的作用仍然未知。鑒于此，作者與他的團隊探究了與超增強子(SEs)相關的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生過程中的功能，并探究了其調節心臟重塑的
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點，也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature，cell級別高分文章領域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼，之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究（詳細見云序課堂之前往期回顧）。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RN
circRNA研究新成果
研究背景放射治療是肝癌治療的有效手段之一，然而放射性肝纖維化是肝癌放射治療的常見并發癥，制約肝癌放療效果。放射性肝纖維化的發病機制仍未明晰，有待進一步研究。環狀RNA（circular RNA，circRNA）是一類廣泛參與多種生物學進程的非編碼RNA，在人類多種疾病的發生和發展中發揮重要作
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點，也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature，cell級別高分文章領域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼，之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究（詳細見云序課堂之前往期回顧）。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RN
中科院Cell子刊發表lncRNA新發現
生物通報道：長非編碼RNA（lncRNA）是一些長度超過二百個核苷酸的RNA分子，來自于基因組的非編碼區域。雖然lncRNA沒有編碼任何蛋白質，但它們在不同組織和發育階段特異性表達。研究者們普遍認為lncRNA具有重要的生物學意義，但對它們的具體功能還知之甚少。 中科院上海生命科學研究院生物化
m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點，也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature，cell級別高分文章領域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼，之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究（詳細見云序課堂之前往期回顧）。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RNA在
雙熒光素酶驗證
miR 和LncRNA/circRNA/mRNA 結合雙熒光素酶驗證方案 一、 檢測原理全基因合成 miR 潛在結合位點上下游~500bp（ LncRNA、circRNA 或 mRNA 的3’UTR）野生形式 WT 及結合位點的突變形式 Mut，克隆到 psiCHECK-2 多克隆位點處
空間轉錄組測序樣本準備指南
一、外泌體研究熱度持續攀升 外泌體（exosome）是活細胞分泌的30-200nm的囊泡，在電鏡下具有非常明顯單層膜結構，通常為茶托型或一側凹陷的半球形。其主要來源于細胞內溶酶體微粒內陷形成的多囊泡體，經多囊泡體外膜與細胞膜融合后釋放到胞外基質中。多種細胞在正常及病理狀態下均可分泌外泌體，
2020年自然研究熱點外泌體研究
一、外泌體研究熱度持續攀升 外泌體（exosome）是活細胞分泌的30-200nm的囊泡，在電鏡下具有非常明顯單層膜結構，通常為茶托型或一側凹陷的半球形。其主要來源于細胞內溶酶體微粒內陷形成的多囊泡體，經多囊泡體外膜與細胞膜融合后釋放到胞外基質中。多種細胞在正常及病理狀態下均可分泌外泌體，
一次RNA甲基化測序的多項成果云序RNA甲基化測序技術...1
一次RNA甲基化測序的多項成果-云序RNA甲基化測序技術大公開文章導讀RNA修飾是表觀遺傳學中調控轉錄后基因表達的關鍵過程，目前對m6A RNA修飾的研究已進行的如火如荼，而除了m6A以外仍有多種RNA修飾類型參與調控轉錄后的基因表達，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修飾以及ac
環狀rna，為什么blast上標注mrna
環狀RNA(circRNA)區別傳統線性RNA類新型RNA具閉環結構量存于真核轉錄組部環狀RNA由外顯序列構同物種具保守性同存組織及同發育階段表達特異性由于環狀RNA核酸酶敏比線性RNA更穩定使其作新型臨床診斷標記物發應用具明顯優勢近已新熱點閱微基于2015始提供lncRNA環狀RNA表達檢測服務運
2020年自然研究熱點外泌體研究
一、外泌體研究熱度持續攀升 外泌體（exosome）是活細胞分泌的30-200nm的囊泡，在電鏡下具有非常明顯單層膜結構，通常為茶托型或一側凹陷的半球形。其主要來源于細胞內溶酶體微粒內陷形成的多囊泡體，經多囊泡體外膜與細胞膜融合后釋放到胞外基質中。多種細胞在正常及病理狀態下均可分泌外泌體，
circRNA機制研究匯總（二）
結合蛋白：（2）CircNfix與Ybx1結合并促進其降解：circNfix和對照組的蛋白質譜分析（A）。采用Ybx1、Nedd4l或陰性IgG抗體進行RIP實驗（云序生物提供該服務）（B）。P0 CMs中過表達circNfix后Ybx1蛋白表達水平（C-D）。qRT-PCR檢測P0 CMs中Y
circRNA機制研究匯總（一）
文章導讀超強子調控circRNA-Nfix缺失誘導成年小鼠心肌梗死后再生circRNAs正在成為心臟發育和疾病強有力的調節因子，但其在心臟再生中的作用仍然未知。鑒于此，作者與他的團隊探究了與超增強子(SEs)相關的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生過程中的功能，并探究了其調節心臟重塑的分子
又傳喜訊云序客戶一次測序兩項成果影響因子合計10分！
感恩有你，一路同行，新年快樂！ 感恩有你，一路同行！2019年伊始，云序生物攜全體員工對一直以來關心和支持公司發展的廣大新老客戶致以最誠摯的問候！一元復始，萬象更新！轉眼間我們迎來了2019年，站在新時代新的歷史起點，回望剛剛過去的2018年，不斷創新收獲碩果豐盈；展望2019，任重道遠卻
lncRNA甲基化如何研究？
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能，這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能輕松的變廢為寶，竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章，你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化，作為最新的國自然熱點受到
不得了，大牛告訴你lncRNA甲基化如何研究
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能，這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能輕松的變廢為寶，竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章，你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。 RNA甲基化，作為最新的國
研究在構建大規模異構生物分子關聯網絡取得進展
中國科學院新疆理化技術研究所多語種信息技術研究室研究生郭鎮豪、易海成在研究員尤著宏的指導下，開展的關于大規模異構生物分子關聯網絡的研究“Construction and Comprehensive Analysis of a Molecular Association Network via l
中外學者Nature子刊發文：環狀RNA翻譯出抑癌蛋白質！
由中山大學、復旦大學、暨南大學、美國安德森癌癥中心等多家單位發表一項發現：使用翻譯組測序技術，在腦膠質瘤細胞中發現了數千種可能翻譯的環狀RNA（circRNA），其中320個有差異表達現象，并具體驗證了一種名為LINC-PINT的環狀RNA可編碼長度為87個氨基酸的蛋白質PINT87aa。 近