賽默飛世爾科技精彩亮相第六屆AOHUPO大會

　　2012年5月5~7日，第六屆亞太人類蛋白質組組織(AOHUPO)大會在國家會議中心卡隆重召開，這是亞太地區規模最大、影響最廣、學術水平最高的蛋白質組學學術峰會。賽默飛世爾科技作為此次大會的金牌贊助商，展示了其蛋白質組學領域的最新產品技術及解決方案。

賽默飛世爾科技展臺

大會入口處擺設了賽默飛產品宣傳旗

　　在6日中午舉辦的午餐招待會期間，來自賽默飛世爾科技蛋白質組學市場總監Andreas FR Huhmer博士為大家詳細介紹了賽默飛高性能質譜對生物研究領域的影響。

午餐招待會現場

賽默飛世爾科技色譜質譜產品中國區高級商務總監 杜平先生

　　首先，賽默飛世爾科技色譜質譜產品中國區高級商務總監杜平先生在首先對賽默飛世爾科技在中國的整體情況進行了簡單的介紹。

　　目前，賽默飛世爾科技在中國擁有215,000平方英尺的廠房，1,900名員工，超過1000名專業技術人員服務用戶，在中國設有8家銷售辦事處，5家應用中心。2010年在上海成立了首個賽默飛世爾中國技術中心。賽默飛世爾科技在中國制造的產品包括科學儀器、環境儀器、過程儀器以及實驗室產品，應用于醫療保健、生命科學、環境、食品安全和工業領域。2012年，賽默飛世爾科技在蘇州科技城投資9000萬美元新建工廠，該工廠將建設成為亞太地區最大的、能夠同時生產包括各類酶標板、細胞培養用品等實驗室耗材，以及二氧化碳培養箱、超低溫冷箱和離心機等實驗設備的基地。

　　最后，杜平先生總結到：賽默飛世爾科技將最大化您的實驗室生產力，幫助解決您的分析難題，提供無以倫比的實驗室產品和技術服務。

賽默飛世爾科技蛋白質組學市場總監 Andreas FR Huhmer博士

　　賽默飛世爾科技蛋白質組學市場總監Andreas FR Huhmer博士介紹了題為《高性能質譜對生物研究領域的影響》的報告。

　　Andreas FR Huhmer博士首先為大家回顧了賽默飛世爾科技質譜的發展歷程。1999年提出了Orbitrap質量分析器的概念；2005年推出了首臺商業化的LTQ Orbitrap質譜；2008年推出集成Orbitrap技術的Exactive新型臺式LC-MS系統；2009年推出了LTQ Orbitrap Velos軌道阱質譜儀；2011年ASMS上相繼推出了Velos Pro雙壓線性離子阱質譜、Q Exactive高性能臺式四極桿-軌道阱質譜儀和Orbitrap Elite高場軌道阱組合質譜儀這三款新品。

　　Orbitrap傅立葉變換電軌道場質量分析器的原理包括：電軌道的離子捕獲，鏡像電流檢測技術，高場軌道阱，和外部的脈沖離子源。2011年新推出的質譜將Orbitrap質量分析器進行了改進，首先將Orbitrap體積縮小，增強了傅立葉變換技術，增加C-Trap中可進行離子聚焦和發射。使得分辨率高達240,000FWHM，最大掃描速度達10spectra/sec，同位素分辨率的質量上限達50kDa。

　　基于質譜技術蛋白質定量方法

　　SILAC技術——質譜定量分析蛋白質

　　SILAC技術的基本原理是分別用天然同位素(輕型)或穩定同位素(重型)標記的必需氨基酸取代細胞培養基中相應氨基酸，細胞經5-6個倍增周期后，穩定同位素標記的氨基酸完全摻入到細胞新合成的蛋白質中替代了原有氨基酸。不同標記細胞的裂解蛋白按細胞數或蛋白量等比例混合，經分離、純化后進行質譜鑒定。

　　同位素標記

　　串聯質譜標記(TMT)方法能夠分析一個樣品的每一個單獨的蛋白，可同時最多分析6個樣品。半胱氨酸串聯質譜標簽（cysTMT）試劑可以富集和定量分析含有半胱氨酸的肽段。

　　Q Exactive：重新定義了定性/定量的工作流程

　　Q Exactive系統重新定義了定性/定量的工作流程，可分析復雜基質中的痕量代謝物、污染物和多肽。它具有新的稱之為“Quanfirmation”的功能，可在一次分析中同時完成化合物的鑒定、定量和確證分析，并具有高達140,000FWHM的分辨率。

Q Exactive質譜系統的內部結構

　　采用多重SIM模式定量分析復雜基質中的蛋白質，第一步在四極桿中選擇目標母離子，第二部離子在 C-Trap中進行聚焦，通過前兩步可使離子在進入Orbitrap質量分析器之前進行反復的累加；第三部經過累加后的離子進入到 Orbitrap質量分析器，在該模式下，多個被獨立分開的母離子可同時進行分析檢測。

　　Thermo Scientific Pinpoint軟件可以定量分析所有的同位素，或者一個又或者是一組同位素，每一個同位素都將得到多個提取離子流圖（XICs），用來定義一個離子。Pinpoint軟件還可提供給分析人員稀釋線，每一次進樣都會對樣品組進行數據計算，通過給出的這些肽段能夠確定定量下限和檢測下限。通過Pinpoint軟件可以很輕易的將肽對進行分組，從而獲得H/L離子化比率并進行絕對定量。

　　HR/AM目標定量分析

HR/AM目標定量分析流程

　　HR/AM定量方法結合了Q Exactivex質譜的高精確質量和高分辨率，可以獲得肽段的高靈敏度和精確質量的定量結果。HR/AM肽段定量分析流程給定性分析提供了一個簡單的轉換，例如針對早期定量分析鑒定和篩查。該分析流程為以前很難進行精確定量分析的蛋白質提供了可靠的分析方法。同時，HR/AM定量方法也是TSQ Vantage三重四極桿質譜SRM分析流程的一個強有力的補充。

　　最后，Andreas FR Huhmer博士總結到目前仍舊需要高性能蛋白質研究工具的出現，以推動發現生物學研究和藥物發現領域中目前沒被發現的人類基因組。一個可被廣泛應用的高分辨率的蛋白質檢測方法的出現，用以滿足目前蛋白質檢測的需求，用來進行復雜蛋白質組學的系統研究。基于高分辨率的Orbitrap質譜能夠消除復雜基質分析中的干擾，增強信心，從而更快的推動周期生物學的研究發展。賽默飛世爾科技致力于技術的創新，不斷推動質譜工具及相關技術的發展，并為用戶提供完整的工作流程解決方案。

　　在大會前期舉辦的培訓期間，來自賽默飛世爾科技蛋白質組學軟件戰略營銷經理David Horn先生介紹了糖蛋白分析的相關軟件方案，包括Proteome Discoverer軟件、ProteinCenter軟件、ProSightPC 軟件的特點及具體應用。

賽默飛世爾科技蛋白質組學軟件戰略營銷經理 David Horn先生

　　Proteome Discoverer軟件

　　靈活的Orbitrap質譜系統能夠產生大量的數據組，大多數的數據庫搜索軟件無法被有效的利用，該問題的解決方案為Proteome Discoverer工作流程能夠集成復雜的MS/MS分析。

　　Proteome Discoverer是一款新的蛋白質組學分析軟件平臺，提供最全面的蛋白質組學定性定量數據查看。Proteome Discoverer使研究者可以在比以往更大的規模上，在一個程序里合并和比較從多個搜索引擎、公共數據庫和裂解方法中獲得的數據，并且易于使用、靈活。

　　Proteome Discoverer一個主要的優點是從多種裂解方法中分析信息的能力，從而去發現更多的翻譯后修飾（PTMs），并提高多肽和蛋白鑒定的準確度。 比如，在單次操作中，CID（碰撞誘導解離）和ETD（電子轉移解離）數據能被同時分析，提供結果的序列、翻譯后修飾和交叉確認信息。

　　使用Proteome Discoverer的工作流程引擎，Proteome Discoverer使研究者可合并搜索引擎結果和公共數據庫信息，提供交叉確認的多種方法。例如，從Mascot?和SEQUEST等不同的搜索引擎中 獲得的數據，可被合并入單個的報告中。其它的軟件特征包括：錯誤發現速率的自動化計算，可允許比較數據庫搜索引擎的結果。

　　ProteinCenter軟件

　　Unimod（www.unimod.org）上包含了673個目前已發現的肽段修飾，所有這些肽段修飾在一個單獨的數據庫里檢索是不切實際的，尤其遇到一個肽段發生多個修飾的情況。那如何能夠最大化的鑒定肽段修飾，并且保證搜索的可行性。針對上述問題賽默飛世爾科技推出了ProteinCenter軟件，該軟件是一個基于網絡的工具，可對蛋白質組學數據執行更快更好的積分，解析和共享。

　　全新Thermo Scientific ProteinCenter軟件是一個基于網絡的工具，可對蛋白質組學數據執行更快更好的積分，解析和共享。它連接著來自Thermo Scientific Proteome Discoverer軟件的以多肽為中心的信息，該軟件還具有以蛋白質為中心內容的常用生物數據庫，如UniProt和NCBI數據庫。用戶可利用這些數 據庫在數分鐘內完成數據的比較和解析。 ProteinCenter? 軟件現在包括超過1300萬個獨特的蛋白質序列，并隔周訪問，更新和整合面向公眾的蛋白質信息。

　　ProSightPC軟件

　　ProSightPC 2.0軟件它最初是為“自上而下”（top-down）的蛋白質鑒定和表征而設計的，現在可以支持所有高質量精度、高分辨率的串聯質譜蛋白質組學實驗。ProSightPC 2.0可以對所有高質量精度的二級質譜（MS2）數據進行高通量處理，無論其來自“自上而下”(top-down)，“自中而下”(middle-down)，還是“自下而上”(bottom-up)的實驗，而且ProSightPC 2.0軟件能夠鑒定任一類型的修飾，包括系列切斷、翻譯后修飾以及單核苷酸多態性。

　　ProSightPC軟件通過重復的搜索從而得到最大化額度鑒定數據組，最大限速的提高分析結果的準確性。