一;儀器:同上
二:試劑:ECL標記盒,其余同上
三:操作:1:將待標記的DNA稀釋至10ng/ml
2:將上述DNA在100℃5分鐘,冰浴5分鐘
3:離心后加入10ulECL標記混合物,混合均勻
4:加10ul戊二醛溶液混勻,37℃20分鐘,此反應液可直接用于雜交也可在50%甘油中-20℃保存。
4:PCR擴增制備帶標記探針
用標記脫氧單核苷酸部分代替PCR反應體系中的脫氧核苷酸(一般是帶標記的dUTP代替dTTP),經PCR擴增后標記基團隨機攙入擴增產物-DNA探針中。這樣使探針濃度高,可檢測標記基團量多,靈敏度高,與缺口平移法制備探針相比,具有方便簡捷的特點,并且由于具高靈敏度因此在檢測低豐度,低拷貝數的目的片斷時,尤其有效。一般可用來進行攙入的帶標記基團可以為同位素標記基團、臭化脫氧尿苷標記基團、也可為其他非放標記基團如生物素、地高辛等。下面以生物素和地高辛為例介紹探針的PCR標記技術。
一:生物素標記
應用bio-11-dUTP部分替代dTTP攙入PCR擴增探針中
操作1:配制反應體系
dNTP的組成dATP、dCTP、dGTP各20mmol,dTTP 15mmol, bio-11-dUTP 5mmol混勻,其他試劑如常規PCR。
2:25循環后,凍存,取出化凍,趁下層水相尚在冰凍狀態,吸盡石蠟油
3:水相中20mg/ml糖原1ul, pH5.2 2.5MnaAC10ul,220ul無水乙醇。混勻后-20℃過夜
4:離心取沉淀,冷凍干燥后100ul水或TE復溶。
二:地高辛標記
應用dig-11-dUTP部分替代dTTP攙入PCR擴增探針中
操作1:配制反應體系
dNTP的組成dATP、dCTP、dGTP各200umol,dTTP 130umol, bio-11-dUTP 70umol混勻,其他試劑如常規PCR。
2:35循環擴增產物
3:擴增產物純化與DIG隨機標記探針方法相同(僅沉淀時,50ulPCR反應液中加入5ul4MliCl和150ul冰乙醇)。
注:1:標記時標記基團在dNTP中占的比例不能太高,因標記基團與dTTP相比具位阻效應,比例太高PCR擴增及以后的雜交都要受到影響。
2:靶DNA用量不能太高,生物素標記中控制在0.2fmol左右;地高辛標記中可低至0.1ng。