乙肝病毒相關性腎炎（即乙肝腎炎）的發病占乙 肝患者的8%-13%，其臨床表現與原發性腎小球腎炎基本一致。因此，有關該病的治療，可基本按原發性腎小球腎炎的方案處理。考慮到乙肝病毒在發病過程中仍起主導作用，尤其是乙 肝活動期或有乙 肝病毒復制指標陽性者，則應試有能使以上各項指標陰轉的中西醫療法，如治療肝炎病毒血癥的干擾素、單磷酸阿糖腺苷、豬苓多糖配合乙 肝疫苗及三苓丹等；還應配合保肝藥如葡醛內酯、水飛薊賓（益肝靈）、立效乙 肝扶正護肝金藥片等治療肝炎。腎炎的治療應分辨是膜性腎炎還是增殖性腎炎，以確定是否應用皮質激素。應用激素一般不會引起肝炎惡化，如能在停用激素后2周再開始應用1個療程的干擾素，效果可能更好些。但有人認為不宜使用腎上腺皮質激素和環磷酰胺，因此類藥能加速乙 肝病毒的復制，從而加重乙 肝病毒感染。
如果患者無乙 肝病毒復制，而腎病綜合征表現較重，則可在嚴密監測下給予小劑量的潑尼松；如肝功正常者，可同時給予環磷酰胺。