查找引起輸尿管擴張的原發疾病，針對病因治療。不管是成人還是兒童，輸尿管擴張處置最重要的是識別哪些患者會需要且通過手術治療而獲益。出生前診斷原發性梗阻性巨輸尿管患者大多數可以在超聲監測下保守治療，72%可以自行緩解，19%需要手術治療，9%會持續擴張，但無癥狀且腎功能無損害。如果超聲監測輸尿管內徑增加則需要行DTPA利尿腎圖檢查。對成人原發性梗阻性巨輸尿管推薦手術治療。對于兒童患者來說，可告知父母有可能自行緩解，如果需要手術治療，通常可以解除梗阻。
1.對癥治療
解痙、止痛、補液、抗炎、中藥治療。
2.排石治療
結石直徑<1.0厘米，腎功能好，無合并感染，病程短，能活動的患者選用。溶石治療：服用藥物，大量飲水，調節尿液pH值，控制飲食種類等方法。適合于尿酸鹽及胱氨酸結石。
3.輸尿管擴張治療
患者在輸尿管鏡直視下，用泥鰍導絲引導通過狹窄環進入膀胱，留置導絲退出輸尿管鏡，再用F8-18號腎筋膜擴張器逐級擴張，然后應用普通金屬尿道擴張器將尿道擴張至可通過F24-26號探子。這樣在直視下置入導絲，減少假道形成、黏膜損傷等并發癥的發生。將狹窄擴張后，還可以在輸尿管鏡直視下觀察，確定狹窄的具體部位、長度，了解尿道黏膜有無損傷，以便進一步治療。
4.經皮腎造瘺術
超聲引導下經皮腎造瘺術操作簡單，安全性高，可以保護腎功能。直接觀察患側腎臟尿量，為手術治療提供機會，且可判斷術后患腎功能恢復情況。
5.輸尿管膀胱再植術
可以采用開放性方式、腹腔鏡方式及機器人輔助腹腔鏡方式等方法進行，通常需要留置輸尿管內D-J管，術后一個月拔除。