染色體分析系統通過攝像機將顯微鏡下觀察到的染色體實時圖像拍攝下來并傳輸到電腦上，再利用染色體圖像分析軟件進行圖像調節處理、分割粘連和重疊的染色體、核型識別與排列、報告設計等操作，最后經檢驗醫生確認后即可打印出圖文并茂，清晰直觀的染色體檢查報告。
熒光檢測儀，直接判讀檢測系統中的熒光信號，根據特定探針的熒光信號變化，直接判斷其對應的染色體DNA鏈上的堿基是否存在，若存在，則出現雜交信號。系統直接記錄熒光信號的變化，從而得出該堿基或突變堿基是否存在的結論。
