自從1940年發現青霉素以來，人類就在不斷地開發新的藥物以治療細菌感染。尤其近20年來，頭孢菌素和新的氟喹諾酮類及大環內酯藥物的出現，為臨床醫師應用抗生素提供了許多選擇，大大地提高了感染患者的治愈率，同時也選擇出許多的耐藥菌株。正是因為抗生素的多樣化和臨床選擇抗生素的隨機性，人們對于抗生素存在著濫用的情況，尤其在急診科存在流水作業，不同的醫生對同一個病人會選擇不同的抗生素，這同時也選擇了細菌，導致了細菌耐藥率的逐年上升。在歐洲，80%以上的下呼吸道感染應用抗生素治療，大多數醫生對急性支氣管炎、慢性支氣管炎急性發作、社區獲得性肺炎、和病毒性呼吸道感染不加以鑒別就應用抗生素，不同的國家抗生素的選擇不一樣。據美國1994~1995年30個醫療中心的統計顯示：約24%的肺炎鏈球菌對青霉素不敏感，14%為中度耐藥，10%為高度耐藥。非典型流感嗜血桿菌耐藥已高達36.4%，而在80年代僅為15%。有一對374例下呼吸道感染患者的前瞻性研究表明：耐藥肺炎鏈球菌感染同先前應用β-內酰胺類抗生素有關。因此合理使用抗生素成為防止細菌耐藥的一大重要策略。要合理的使用抗生素，除了加強規范化的經驗性治療外，最重要的是明確感染患者病原菌及其藥敏情況，以便針對性的使用抗生素。因此快速而準確的細菌培養是急需解決的問題。
下呼吸道感染是指聲門以下的呼吸道的感染。包括社會獲得性和醫院內獲得性，在臨床上極為常見，其病原菌種類繁多，院內感染者多以革蘭氏陰性桿菌多見，混合感染也較多。臨床表現也多種多樣，通過胸片和癥狀體征難以鑒別感染的細菌類型，因此病原學檢查非常重要。準確獲取病原學證據有利于及早明確診斷，根據藥敏及時地進行抗菌治療。獲取病原菌的方法多種多樣，如血培養，痰涂片和痰培養及經氣管吸引術采痰、纖支鏡保護性毛刷及肺泡灌洗和肺活檢等。血培養陽性率低，其臨床應用價值有限，而經氣管吸引術采痰、纖支鏡保護性毛刷及肺泡灌洗和肺活檢均為有創檢查，一般患者難以接受，限制了其在臨床中的廣泛使用。而痰為下呼吸道的分泌物，其病原菌的情況最能真實的反應下呼吸道的感染情況，因此痰涂片鏡檢和痰培養一直受到臨床上的關注，且常規用以指導臨床治療。對此國內外學者為快速而準確的獲取病原學證據作了大量的工作，本文就此進行綜述，以利于獲取合格的痰標本和快速而準確的細菌學證據。
1、痰細菌培養存在的問題
細菌培養的過程包括臨床痰標本的留取和實驗室的接種培養及鑒定，二者均直接影響細菌培養的結果，必需同時加以改進，才能提高培養的準確性。幾十年來，對于痰標本的臨床價值一直存在著爭議，其原因主要有：(1)大多數的下呼吸道感染患者有咳嗽咳痰的癥狀，但咳痰量因人而異，臨床上約有10-30%的患者干咳無痰或咳痰無力，通過自主咳嗽無法獲取痰標本；(2)人體口咽部寄居有大量的正常菌群，尤其是長期住院患者，口腔中的革蘭氏陰性桿菌的數量明顯增多，咳出的痰液在口腔中停留易被污染，從而影響檢查結果；(3)約15-30%的患者在痰標本留取前已經使用過多種抗生素，一些比較脆弱的細菌如肺炎鏈球菌和流感嗜血桿菌在應用抗生素后，取任何呼吸道標本的檢出率為0，實際上檢出的細菌很大程度上是對所應用的抗生素耐藥的細菌，從而使藥敏結果對臨床用藥的指導意義大大降低；(4)目前絕大多數的醫院采用的培養基為2種，即血平板和伊紅-美蘭平板，使得許多導致呼吸道感染的病原菌不能被分離出來。流感嗜血桿菌是慢性阻塞性肺疾病急性發作期第1位常見的致病菌，其培養需要巧克力培養基和CO2培養箱，但一般實驗室都不進行該培養基的培養，從而使得許多常規培養為陰性，這樣痰培養對指導臨床用藥的幫助大大降低；(5)對于常規痰培養而言，實驗室多采用白金耳環取痰中極少一部分在培養基中劃線培養由于痰中細菌的數量和種類的分布不均勻，接種時可能所取的部位沒有致病菌或只接種了一部分致病菌，這使培養的陽性率大大降低。盡管如此，痰液畢竟是下呼吸道的分泌物，其病原菌情況最能真實地反應感染的細菌，因此提高痰培養的準確性是臨床醫生和細菌學工作者極其關注的問題，并對此作了許多改進，從而更有效地指導臨床用藥。