如果提取的痘苗病毒DNA用于轉染,則應在蛋白酶 K 消化和苯酚抽提后分離。具體方法見本實驗。
實驗材料 | |
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試劑、試劑盒 | Tris?Cl 溶液SDS蔗糖溶液蛋白酶 K用 50 mmol/L Tris ? Cl 溶液平衡的苯酚1:1苯酚氯仿1 mol/L 乙酸鈉乙醇 |
儀器、耗材 | |
實驗步驟 | 1. 在 260 nm 處確定純化的疸苗病毒的光密度,將 20 個光密度單位的病毒(見「痘苗病毒純化實驗」 步驟 24)加入到 50 mmol/L pH 7.8 的 Tris ? Cl 緩沖液中,終體積為 1.2 ml。 2. 將以下溶液加到病毒懸液中(終體積為 2 ml): 0. 1 ml 1 mol/L pH 7.8 的 Tris ? Cl 0.1 ml 10% SDS 0.2 ml 60% 蔗糖溶液 0.4 ml 10 mg/ml 蛋白酶 K 37℃ 溫育 4 h。 3. 用苯酚抽提 2 次,每次加入等體積的平衡苯酚,搖動離心管輕輕混勻,室溫,300 g 離心 10 min,用去掉頭部的槍頭將上層水相吸出保留。 4. 用步驟 3 所述的方法,再用 1:1 的苯酚氯仿抽提 1 次。 5. 加入 1/10 體積的 1 mol/L pH 7.0 的乙酸鈉和 2.5 體積的 100% 乙醇。輕輕混勻,并在 -20℃ 冷凍幾個小時。 6. 以最大的速度 4℃ 微量離心 10 min,吸棄上清。 7. 用 95% 乙醇清洗沉淀 2 次,每次加入乙醇后以最大速度微量離心,吸出上清。空氣干燥后用 100 μl 的水溶解。 8. 制備稀釋液(僅取一小部分),用 A260 測定 DNA 濃度。 |
注意事項 | 在本操作中不要渦旋 DNA。因為痘苗病毒的基因組很大,如果想得到完整長度的 DNA(如用于限制酶切分析)就必須小心操作,以免剪切 DNA。 |