1溴化乙錠是一種高度靈敏的熒光染色劑,用于觀察瓊脂糖和聚丙烯酰胺凝膠中的DNA.
2溴化乙錠可以嵌入堿基分子中,導致錯配.許多人認為溴化乙錠是強誘變劑,具有高致癌性.
溴化乙錠用標準302nm 紫外光透射儀激發并放射出橙紅色信號,可用Polaroid 底片或帶CCD 成像頭的凝膠成像處理系統拍攝.
溴化乙錠含有一個可以嵌入DNA堆積堿基之間的一個三環平面基團.它與DNA的結合幾乎沒有堿基序列特異性.在高離子強度的飽和溶液中,大約每2.5個堿基插入一個溴化乙錠分子.當染料分子插入后,其平面基團與螺旋的軸線垂直并通過范德華力與上下堿基相互作用.這個基團的固定位置及其與堿基的密切接近,導致與DNA結合的染料呈現熒光,其熒光產率比游離溶液中染料有所增加.DNA吸收254nm處的紫外輻射并傳遞給染料,而被結合的染料本身吸收302nm和366nm的光輻射.這兩種情況下,被吸收的能量在可見光譜紅橙區的590nm處重新發射出來.由于溴化乙錠-DNA復合物的熒光產率比沒有結合DNA的染料高出20-30倍,所以當凝膠中含有游離的溴化乙錠（0.5ug/ml）時,可以檢測到少至10ng的DNA條帶.