蛋白質組學實用分析技術一覽
分析其實也屬于技術的一部分，且在蛋白質組學研究中顯得尤為重要，因為蛋白質組學研究提供的數據是生物學上最龐大的，而且蛋白質組比基因組具有更大的復雜性，因此蛋白質組信息學更有挑戰性。今天小編先拋磚引玉地介紹幾個常用的分析方法和軟件。蛋白質定性分析蛋白質定性分析通常是指利用質譜法進行蛋白質鑒定和序列分析。蛋白質定性分析分為top-down分析和bottom-up分析兩種策略。目前，bottom-up分析策略被更廣泛的應用于蛋白質定性分析工作。根據使用儀器可分為：MALDI-TOF/TOF、LC-ESI-MS/MS根據樣本類型可分為：蛋白質全譜分析（即shotgun分析） 、蛋白質膠條/混合液分析、蛋白質膠點分析蛋白質全譜分析定義：蛋白質全譜分析也可稱為質譜shotgun分析，是指組分分析，能夠鑒定出盡可能多的肽和蛋白質分子。原理：將溶液內蛋白質分子或SDS-PAGE條帶的復雜混合物酶解成肽段混合物，通過液相色譜分離。串聯質譜測試，最后......閱讀全文
質譜樣本制備技術資料
試劑耗材： Milli-Q water、Non-powder gloves、Face mask、Hat、10μl and 200μl tips（eppendorf）、Menthol(Fisher M/4056/17)、Acetonitrile(Fisher A/0626/17)、Try
Creative Proteomics發布兩款質譜產品
分析測試百科網訊 2016年7月4日，Creative Proteomics，一家提供蛋白質組學相關領域，藥物開發服務和產品的供應商，發布了兩款質譜新產品——天然化合物MS Std和Sialic acids，這也標志著Creative Proteomics質譜產品的擴張。 質譜，在很
PNNL發表開源蛋白質組學軟件Informed-Proteomics
分析測試百科網訊 一則消息可能對蛋白組學研究者們最頭痛的事有一定的緩解。美國一機構介紹了一款用于分析鑒定完整蛋白質的新型開源軟件。 ProMex中的LS-MS特征查找，該功能是Informed-Proteomics軟件套件的第一個組件的特征檢測算法。 它被開發用于檢測完整蛋白質離子的同位素包膜
質譜和蛋白質組學：擊中目標
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)?? 作者：Nathan Blow?? 分析測試百科? 譯 ??? 近年來，質譜儀大幅提高了動態范圍和靈敏度，使研究者們在疾病生物標志物的發現和驗證方面，更從容地面對挑戰。 ??? 在2008年6月的美國質譜大會（ASMS）
質譜樣本前處理步驟
生物樣品基質復雜，且待測目標物多為內源性的化合物，如血清樣本含有蛋白質、多肽、氨基酸、脂類、糖類、無機鹽、維生素、有機酸、激素等。因此為了降低基質干擾、延長色譜柱使用壽命、防止系統堵塞損壞、提高檢測靈敏度和特異性，往往需要對樣品進行沉淀、萃取、凈化、富集等前處理。?目前常用的樣本前處理方法有：蛋白沉
質譜樣本前處理步驟
生物樣品基質復雜，且待測目標物多為內源性的化合物，如血清樣本含有蛋白質、多肽、氨基酸、脂類、糖類、無機鹽、維生素、有機酸、激素等。因此為了降低基質干擾、延長色譜柱使用壽命、防止系統堵塞損壞、提高檢測靈敏度和特異性，往往需要對樣品進行沉淀、萃取、凈化、富集等前處理。?目前常用的樣本前處理方法有：蛋白沉
Orbitrap質譜蛋白質組沙龍在京舉行
【導語】使用質譜儀器進行蛋白質組研究中有三個關鍵環節，第一個是樣品的處理階段，這是最簡單，也是最重要的一個步驟。第二個階段是儀器的操作部分，使用液相、質譜等儀器把蛋白質進行分離、分析。主要涉及儀器參數的優化調整。第三步是生物信息學分析部分，這也是最難的部分。本期沙龍中中科院生物物理所的
細菌表達蛋白質和樣本制備
一般直接用SDS凝膠加樣緩沖液裂解，具體方法如下：[試劑與設備]（1）表達待檢測蛋白質的細菌。（2）50mmoL／LTris-HCl（pH7.4）。（3）2xSDS凝膠加樣緩沖液：100mmol／L Tris—HCl（pH6.8）200mmol／L 二硫蘇糖醇（DTT）4％ SDS（電泳級）0.2％
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（四）
無論是相對定量還是絕對定量方法,DIA很好地克服了DDA鳥槍法和SRM目標監測的種種不足, 在定量蛋白質組學中具有良好的應用前景。然而,目前DIA 方法的循環時間仍然較長,只能與納流液相聯用,并使用較長的梯度以獲得足夠的色譜峰寬,限制了DIA 的應用范圍。這也是DIA 技術下一步需要解決
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（三）
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有