高通量測序技術總結與展望

　　第一代測序技術憑借其長的序列片段和高的準確率，適合對新物種進行基因組長距框架的搭建以及后期GAP填補，但是成本昂貴，而且難以勝任微量DNA樣品的測序工作。第二代測序技術中，454序列片段最長，比較適合對未知基因組從頭測序，搭建主體結構，但是在判斷連續單堿基重復區時準確度不高。Solexa較454具有通量高、片段短、價位低的特點，可以用于大基因組和小基因組的測序和重測序。Solexa雙末端測序(paired-end sequencing)可以為基因組進一步拼接提供定位信息，但是隨著反應輪數增加，序列長度和質量均有所下降，而且在閱讀AT區時有明顯錯誤傾向。SOLiD基于雙堿基編碼系統的糾錯能力以及較高的測序通量，適合轉錄本研究以及比較基因組學特別是SNP檢測等，但是測序的片段短限制了該技術在基因組拼接中的廣泛應用。第三代測序技術目前正在研發階段，尚未正式投入使用。