臨床上對早期發現的胰腺假性囊腫應先采用內科保守方法治療。
（1）內科治療 如伴急性胰腺炎，應使胰腺處于休息狀態減少胰液的外滲控制囊腫進一步發展。方法包括嚴格禁食3周左右，胃腸減壓應用H2受體拮抗藥及生長抑素以減少胰泌素和膽縮素-促胰酶素的分泌，使胰腺分泌功能處于靜止狀態；維持水電解質平衡，進行靜脈營養支持等，早期應用能通過血胰屏障的抗生素，如喹諾酮類和氯、林可霉素（潔霉素）等抗生素，以預防和治療胰腺感染。中晚期選用廣譜抗生素如第三代頭孢菌素和氨基糖苷類。
（2）單純細針抽吸 復發率高達50%～98%，反復穿刺不僅給病人帶來痛苦，且易導致逆行感染。
（3）經皮置管引流 ①適應證 凡急性胰腺假性囊腫，經B超CT證實為單房性，出現以下情況：囊腫快速增大有破裂可能；囊腫合并感染；囊腫巨大壓迫周圍臟器造成功能障礙者。②方法 通常在B超或CT引導下進行，一般用>8號FJ型管，每天用抗生素鹽水沖洗1～2次。③拔管指征 囊腫塌陷；24小時引流液<10ml；囊腫造影證實導管通暢，囊腫與胰管或消化道不交通。由于長期置管可壓迫消化道易致內瘺，并可發生逆行感染導管折斷等并發癥因此對于即使囊腫與胰管或消化道相通或囊內分隔多引流不暢歷時6周不愈者，應放棄置管，改行手術內引流治療。
（4）內鏡治療 可以通過內鏡行囊腫胃腸吻合術和內鏡囊腫十二指腸吻合術。對于有胃腸道壓迫癥狀，直徑>6厘米以上的特別是位置在十二指腸旁的胰頭部囊腫又不適宜手術者，選擇內鏡治療是較安全的。本法特別適用于年齡較大，不能耐受手術者。