鉤端螺旋體屬于螺旋體目(order Spiroehaetalis) 密螺旋體科(family Treponema-taceae)，鉤端螺旋體屬(genus Leptospira)。是一種纖細的螺旋狀微生物，菌體有緊密規則的螺旋，長4～20μm,寬約0.2μm。菌體的一端或兩端彎曲呈鉤狀，沿中軸旋轉運動。旋轉時，兩端較柔軟，中段較僵硬。
光學顯微鏡下鉤端螺旋體
鉤端螺旋體不易著色，在普通顯微鏡下難以看到，需用暗視野顯微鏡觀察，在黑色背影下可見到發亮的活動螺旋體(如圖)。亦可用鍍銀法染色檢查，菌體呈深褐色或黑色。由于鉤端螺旋體的直徑很小，菌體柔軟易彎曲以及其特有的運動方式，所以能穿過孔徑為0.1～0.45/μm的濾膜，并能穿入含1%瓊脂的固體培養基內活動。
鉤端螺旋體對熱、酸、干燥和一般消毒劑都敏感。在人的胃液中30分鐘內可死亡。在膽汁中迅速被破壞，以致完全溶解。在堿性水中(pH7.2～7.4)能生存l～2個月，在堿性尿中可生存24小時，但在酸性尿中則迅速死亡。
50～56攝氏度半小時或60攝氏度10分鐘均能致死，但對低溫有較強的抵抗力，經反復冰凍溶解后仍能存活。鉤端螺旋體對干燥非常敏感，在干燥環境下，數分鐘即可死亡。常用的消毒劑如：1/20，000來蘇溶液，1/1000石碳酸、1/100漂白粉液均能在10～30分鐘內殺死鉤端螺旋體。
當前鉤端螺旋體屬分為兩個種即：問號鉤端螺旋體(L.interrogens)和雙曲鉤端螺旋體(L.biflexa)，前者對人與動物致病，后者自由生活。