文件傳輸是數據交換的主要形式。在進行文件傳輸時，為使文件能被正確識別和傳送，需要在兩臺計算機之間建立統一的傳輸協議。這個協議包括了文件的識別、傳送的起止時間、錯誤的判斷與糾正等內容。常見的傳輸協議有以下幾種：
ASCII：這是最快的傳輸協議，但只能傳送文本文件。
Xmodem：這種古老的傳輸協議速度較慢，但由于使用了CRC錯誤偵測方法，傳輸的準確率可高達99.6%。
Ymodem：這是Xmodem的改良版，使用了1024位區段傳送，速度比Xmodem要快。
Zmodem：Zmodem采用了串流式（streaming）傳輸方式，傳輸速度較快，而且還具有自動改變區段大小和斷點續傳、快速錯誤偵測等功能。這是最流行的文件傳輸協議。
除以上幾種外，還有Imodem、Jmodem、Bimodem、Kermit、Lynx等協議。