分衍生化常用的反應有酯化、酰化、烷基化、硅烷化、硼烷化、環化和離子化等。雖然氣相色譜已有許多衍生化方法，但它有一個致命的缺點是不能用于熱不穩定化合物。此外，對于一些有復雜基質的實際樣品，除分離上的困難外，還容易污染進樣器和損壞柱子。
衍生化反應從是否形成共價鍵來說，可分為兩種：標記和非標記反應。標記反應是在反應過程中，被分析物與標記試劑之間生成共價鍵；所有其它類型的反應，如形成離子對、光解、氧化還原、電化學反應等都是非標記反應。另一種區分衍生化反應是從衍生反應的場所來分，有柱前衍生化(pre-columnderivatization)，柱上衍生化(on-columnderivatization)和柱后衍生化(post-columnderivatization)三種。從是否與儀器聯機的角度來分有：在線(on-line)、離線(off-1ine)和旁線(at-line)(自動化)三種。目前在HPLC中以離線的柱前衍生法(簡稱柱前衍生法)與在線的柱后衍生法(簡稱柱后衍生法)使用居多，旁線衍生化方法是發展方向。
柱前衍生法和柱后衍生法各有其優缺點。柱前衍生法的優點是：相對自由地選擇反應條件；不存在反應動力學的限制；衍生化的副產物可進行預處理以降低或消除其干擾；容易允許多步反應的進行；有較多的衍生化試劑可選擇；不需要復雜的儀器設備。缺點是：形成的副產物可能對色譜分離造成較大困難；在衍生化過程中，容易引入雜質或干擾峰，或使樣品損失。柱后衍生法的優點有：（1）形成副產物不重要，反應不需要完全，產物也不需要高的穩定性，只需要有好的重復性即可；（2）被分析物可以在其原有的形式下進行分離，容易選用已有的分析方法。缺點是：（1）對于一定的溶劑和有限的反應時間來說，目前只有有限的反應可供選擇；（2）需要額外的設備，反應器可造成峰展寬，降低分辨率。