除敗血癥、心內膜炎、腦膜炎、肺炎，中毒性休克綜合征等外，無并發癥的葡萄球菌皮膚和軟組織感染、食物中毒、骨髓炎、尿路感染等的預后均屬良好。金葡菌食物中毒雖發病急驟，吐、瀉劇烈，但恢復也快。自對金葡菌有效的抗菌藥物應用以來，慢性骨髓炎伴竇道形成的病例已屬罕見。表葡菌和腐葡菌所致的尿路感染很少成為治療上的難題。燙傷樣皮膚綜合征的病勢雖較兇險，但大多數患兒經處理后順利恢復。葡萄球菌敗血癥、心內膜炎、腦膜炎和肺炎的預后則較差，雖在有效藥物的治療下，其病死率仍然較高。
