胰腺假性囊腫多繼發于急慢性胰腺炎和胰腺損傷，由血液、胰液外滲以及胰腺自身消化導致局部組織壞死崩解物等的聚積，不能吸收而形成，囊壁由炎性纖維結締組織構成，囊內無胰腺上皮層襯墊，因此稱為胰腺假性囊腫。
急性胰腺假性囊腫是指囊腫內容急性聚積而成的囊腫，多繼發于急性胰腺炎和胰腺損傷。急性胰腺炎的病因隨不同國家與地區而異，在國內膽石誘發的急性胰腺炎占多數，酗酒引起的較少；而歐美國家酒精性急性胰腺炎占多數,膽石性僅占10%。
慢性胰腺假性囊腫是在慢性胰腺炎基礎上因胰管梗阻破裂所致。慢性胰腺炎的病因主要為膽石、酗酒與損傷，少見于高脂血癥、原發性甲狀旁腺功能亢進的高鈣血癥等。