本病之病原體為肺炎衣原體。1965年Grayston首次在一中國臺灣兒童之結膜分泌物中,分離出一株與其他衣原體不同的衣原體,當時命名為TW(Taiwan)-183,1983年又在美國西雅圖1名急性呼吸道感染的大學生咽部分泌物中,分離出另一株衣原體而命名為AR-39(acuterespiratory-39)后經研究鑒定,發現此兩株實為同一種衣原體,1989年正式命名為TWAR,又稱肺炎衣原體。