1、呼吸系統疾病
呼吸系統疾病引起的肩背部疼痛，其部位一般在后背、側背部或肩胛部，常見的疾病有胸膜粘連、肺癌及結核等。
鑒別要點：
(1)肩背部疼痛多伴有呼吸系統癥狀與體征。
(2)呼吸時肩背部疼痛加劇。
(3)脊椎檢查無病變、運動不受限、局部無壓痛。
(4)胸部影像學檢查可見肺或胸膜病變。
2、循環系統疾病
心血管疾病引起的肩背部疼痛。以心絞痛、心肌梗死最常見。
鑒別要點：
(1)疼痛部位多位于胸骨后或心前區，可向肩部放射。
(2)常因體力活動而誘發或加劇，休息后好轉。
(3)疼痛常為短暫一過性，應用血管擴張藥、吸氧后疼痛可迅速減輕或消失。(4)發作時檢查心電圖可發現心肌缺血改變。
3、消化系統疾病
消化系統疾病引起的肩背部疼痛，常見的有膽絞痛、胰腺疾病、胃及十二指腸腫瘤等。鑒別要點：(1)疼痛一般有固定部位。如膽絞痛常牽涉至右胸背部；胰腺疾病常牽涉至左腰背部；胃及十二指腸腫瘤或穿透性潰瘍常牽涉至后背中部。
(2)疼痛發作常與飲食因素有關。
(3)超聲和消化道造影可明確診斷。
4、骨腫瘤或臟器腫瘤轉移
骨腫瘤或其他器官腫瘤，如腎、膀胱、子宮、肺等腫瘤轉移至肩胛骨、椎體骨、肋骨可引起的肩背部疼痛，鑒別要點為：
(1)一般可追查到原發病或追溯到原發灶手術史。
(2)疼痛癥狀呈持續性加重，部分患者可觸及包塊。
(3)X線檢查可發現肩背部有癌性骨溶或骨占位性病變。