肥大細胞來源于造血干細胞，但是實際上，由骨髓剛進入外周血液循環系統的肥大細胞仍處于未成熟狀態，只有當它們的前體細胞遷移到最終定居的地方，即血管組織或漿膜腔中才能完成分化和(或)成熟。在哺乳類以及其他脊椎動物中，肥大細胞廣泛分布于整個血管組織，尤其是皮下或皮膚內，以及接近血管、神經、平滑肌、分泌黏液的腺體和發囊部位。肥大細胞主要分布于機體與外界環境相通的地方，如皮膚、氣道和消化道，這些部位經常可以接觸到病原體、變應原以及其他環境中的物質。
因此，肥大細胞在體內的分布特點，使得它與DC一起成為造血-免疫系統中首先與環境中變應原、其他抗原以及入侵病原體相互作用的細胞群。