從化學結構來看細胞信號分子包括：短肽、蛋白質、氣體分子（NO、CO）以及氨基酸、核苷酸、脂類和膽固醇衍生物等等，其共同特點是：
①特異性，只能與特定的受體結合；
②高效性，幾個分子即可發生明顯的生物學效應，這一特性有賴于細胞的信號逐級放大系統；
③可被滅活，完成信息傳遞后可被降解或修飾而失去活性，保證信息傳遞的完整性和細胞免于疲勞。
