鱗狀上皮細胞癌抗原的臨床意義：血清SCCA測定對各種鱗狀上皮細胞癌的診斷均有很高的特異性，是外陰、陰道和宮頸鱗狀上皮細胞癌的有效和敏感的標記物。對外陰及陰道的原發癌，敏感性40%~50%；對原發性子宮頸鱗癌，診斷敏感性可達50%~70%；對復發癌診斷的敏感性可達65%~85%。宮頸癌患者血清SCCA濃度高低與臨床期別呈正相關，SCCA水平的升降與疾病進展或好轉相致。動態監測血清SCCA水平可作為宮頸癌病情監測的一個指標，宮頸癌患者治療后血清SCCA水平再次上升，或治療前血清SCCA陰性，治療后SCCA反呈陽性反應時應考慮為癌瘤復發，且血清SCCA水平升高較臨床出現復發跡象或影像學提示腫瘤復發為早。
值得注意的是，正常體液如汗液、唾液和其他體液內亦可有SCCA，若標本受到此類體液的污染，甚至噴嚏亦可能污染標本而導致假陽性，故SCCA升高的標本宜作重復測定。