不伴有運動功能失調的膈上食管憩室一般無癥狀。憩室較大并有運動功能失調者可以產生不同程度的癥狀,從輕度消化不良至明顯吞咽困難或反流,其他常見主訴有胸骨下及上腹不適、疼痛,少數病例中疼痛向肩部放散,類似心絞痛。憩室增大的病例可出現吞咽梗阻造成體重下降及營養不良。憩室內容可以發生口臭,向上反流可以發生誤吸出現呼吸道癥狀。