嬰幼兒常表現為尿路感染與反流的非特異性癥狀，包括發熱、乏力、嗜睡、厭食、惡心嘔吐及生長發育遲滯，也可有腎絞痛及腎區壓痛。如繼發感染，會出現尿頻、尿急、尿痛癥狀。嚴重感染時，可出現膿尿。偶爾勞累后也會出現酸痛。合并腎瘢痕形成者可因高血壓就診。其最嚴重的后果是發生腎盂腎炎性瘢痕，導致繼發性高血壓及慢性腎功能不全。體格檢查時除可觸及增大的腎臟外，偶可觸及增粗的輸尿管。腎區可有輕度的叩擊痛。雙側膀胱輸尿管回流現象者，可有腎功能不全的癥狀。
