24小時尿肌酐可以輔助診斷很多臨床疾病，如尿蛋白肌酐比值可以幫助診斷糖尿病早期腎損害；尿淀粉酶與尿肌酐的比值可以輔助診斷急性胰腺炎；24小時尿肌酐與血肌酐同時檢測，可計算出24小時肌酐清除率。肌酐清除率是臨床上用于評估腎小球濾過率的主要指標之一，為急、慢性腎病的診斷、檢測和預后提供科學的依據。
1.增高：體內肌酐生成過多的疾病，如肢端肥大癥、巨人癥、糖尿病、感染、甲狀腺功能減退癥等。
2.降低：腎衰、重度充血性心力衰竭等。
另外，進食肉類、劇烈運動、服用維生素C、左旋多巴、甲基多巴等，可使尿肌酐升高；素食者、服用雄激素、噻嗪類藥物可使尿肌酐測定結果降低。