將不同的填料作為固定相裝入微型小柱,當含有藥物的生物樣品溶液通過時,由于受到“吸附”或“分配”或“離子交換”或其它親和力作用,藥物或雜質被保留在固定相上,用適當的溶劑洗除雜質,再用適當溶劑洗脫藥物。
洗脫方式有兩種:
一種是藥物比雜質與固定相之間的親和力更強,因而被保留,然后用一種對藥物親和力更強的溶劑洗脫;
另一種是雜質較藥物與固定相之間親和力更強,則藥物被直接洗脫。通常使用的是前一種模式。