離子阱分析器它是由環行電極和上、下兩個端蓋電極構成的三維四極場。原理：將離子儲存在阱里，然后改變電場按不同質荷比將離子推出阱外進行檢測。
功能強大
離子阱有全掃描和選擇離子掃描功能，同時具有離子儲存技術，可以選擇任一質量離子進行碰撞解離，實現二級或多級MSn分析功能。但離子阱的全掃描和選擇離子掃描的靈敏度是相似的。廣泛應用于蛋白質組學和藥物代謝分析。已經出現了很多離子阱質譜與其它分析儀器聯用的技術，如氣相色譜-離子阱質譜聯用儀（GC-ITMS）、FTR-ITMS聯用技術。
