神經母細胞瘤的初發癥狀不典型，因此在早期診斷有
所困難。比較常見的癥狀包括疲乏，食欲減退，發燒以及關節疼痛。腫瘤所導致的癥狀取決于腫瘤所處的器官以及是否發生轉移。
腹腔的神經母細胞瘤一般表現為腹部膨隆以及便秘；胸腔神經母細胞瘤一般表現為呼吸困難；脊髓神經母細胞瘤一般表現為軀干與肢體力量減退，患者往往會有站立、行走等困難；腿部以及髖部等骨頭的神經母細胞瘤可以表現為骨痛以及跛行；骨髓的破壞可以使患者由于貧血所導致的皮膚蒼白。大部分神經母細胞瘤（50-60%）在出現臨床表現前，已發生廣泛轉移。原發神經母細胞瘤最常見的發生部位為腎上腺（約占40%）；其他原發器官包括頸部（1%）， 胸腔（19%）， 腹腔（30%），以及盆腔（1%）。另有一些罕見的病例，找不到原發病灶。罕見但具有特征性的臨床表現包括脊髓橫斷性病變（脊髓壓迫，占5%）， 頑固性腹瀉（腫瘤分泌血管活性腸肽，占4%），霍納綜合征（頸部腫瘤，占2.4%），共濟失調（腫瘤的旁分泌所致，占1.3%），以及高血壓（腎動脈受壓或者是兒茶酚胺分泌，占1.3%）。