1、指甲混濁、灰指甲真菌侵入甲板或甲床后，由于大量的菌絲和孢子的迅速繁殖，使得甲床上角質物大量的堆積，肉眼查看，甲板變得混濁，不透明，故甲真菌病俗稱為灰指(趾)甲。
2、指甲增厚，真菌侵入甲板或甲床后，甲板中的角質物受到真菌的作用而高度增殖，角質物的堆積使甲板增厚。甲板的增厚也加深了甲床混濁程度，一般它可以比正常甲板厚出1～3倍以上。
3、指甲表面凹凸不平，由于甲板或甲板下有角質物堆積，同時甲板又被破壞，使甲板表面粗糙，凹凸不平，失去光澤。這種凹凸不平既為縱向，也可以為橫向。同時也可以理解到病甲的主要病變在甲板下。
4、指甲甲板變脆易碎，由于真菌侵入甲板和甲床，在角質溶解酶的作用下，角質但白被溶解，形成角質細小顆粒，被破壞的甲板缺乏彈性和韌性而變脆，角質顆粒呈粉末狀易于脫落、松散而變得碎雜。
5、指甲分層灰指甲增厚的角質物變干，變碎屑，變脆，它容易從甲板與甲床之間脫落下來，使得原本與指肉粘合的指甲表層，出現中空現象，即指甲分為2層，表層與指肉分離，另外分離出一層薄薄的甲質粘在指肉上。