生物標志物研究與早期藥物研發基因表達分析功...（一）

生物標志物研究與早期藥物研發基因表達分析功能學檢測RealTime ready 應用

生物標志物研究與早期藥物研發基因表達分析功能學檢測RealTime ready應用

Sabine Lohmann*, Andrea Herold*, Tobias Bergauer#, Anton Belousov+, Gisela Betzl *, Manuel Dietrich*, Manuela Poignée-Heger *, David Geho’, Martin Weisser+

*Roche Applied Science, Penzberg, 德國
+Roche Pharma, Penzberg, 德國
#Roche Pharma, Basel, 瑞士
 ’Roche Pharma, Nutley, 美國

前言

生物標志物與早期臨床藥物研發抗-TWEAK復合物研發舉例
TWEAK（腫瘤壞死因子樣細胞凋亡弱誘導因子）是一種多功能細胞因子，可控制包括細胞增殖、遷移、分化、凋亡、血管生成，以及炎癥在內的多種細胞活動。TWEAK通過與Fn14結合發揮作用，Fn14  是一種具有高度誘導性的細胞表面受體，與包括細胞核因子- kB（NF-kB）途徑在內的多種細胞內信號途徑具有相關性（2）。

根據文獻搜索與TWEAK信號轉導途徑生物學芯片數據，應用“關鍵詞”搜索功能，于RealTime ready配置門戶網完成一個RealTime ready NF-kB定制型多孔檢測板的配置。為生成首個假設，使用RealTime ready NF-kB panel，于9種不同的腫瘤細胞系（經過處理細胞系對未處理細胞系，于不同時間點，共使用 54 份樣本）中，進行體外基因表達分析。根據細胞系結果，使用簡化 NF-kB panel（35種參數），確認體內小鼠移植模型中的潛在生物標志物。基于細胞系與移植物測定結果，鑒定出13種潛在性、候選基因。為對假設進行檢驗，從上述參數中篩選出 6 種參數，進行人FFPE樣本分析。上述6種參數與所選參考基因適合于感興趣的實體腫瘤（BC、CRC、NSCLC、肉瘤、RCC）。已經開發出RealTime ready qPCR檢測，并已經進行FFPET RNA分離功能的優化。

個體化醫療（PHC）根據基因信息，針對個體的遺傳獨特性，對個體進行衛生保健、疾病預防與治療服務，滿足個體需要。對特定生物狀態指示劑的生物標志物分子的識別與鑒定，在個體化醫療中具有重要作用（1）。因此，生物標志物是藥物從靶點鑒定至藥物應用生命周期的核心元素。前列腺素特異性抗原
（PSA）、c-反應蛋白（CRP），與HER2/neu僅是眾多生物標志物分子中的少數幾個。

生物標志物研究中，人們對復雜生物背景下mRNA表達研究抱有濃厚興趣。RealTime ready RT-qPCR檢測與RealTime ready 配置門戶網站在線完成相關標志物基因的選擇，qPCR功能檢測有助于了解基因表達概況。LightCycler?480多孔板上RealTime ready 定制型檢測多孔板上含有用戶選擇的、預置人、小鼠或大鼠靶序列qPCR檢測(https://configurator.realtimeready.roche.com)。我們已經建立起細胞系（體外）、移植小鼠模型（體內），與各種人類研究樣本FFPET切片生物標志物研究的基因表達分析工作流。