禁止與其它二磷酸鹽同時使用。 氯膦酸二鈉與非甾體類抗炎止痛劑（NSAIDs）合用，最常見的是雙氯芬酸，有引起腎功能不全的報告。 由于發生低鈣血癥的風險增加，氯膦酸鹽與氨基糖苷類抗生素同時使用時應特別謹慎。 曾有報告，氯膦酸鹽與磷酸雌莫司汀同時使用時，磷酸雌莫司汀的血清濃度最高增加80％。 氯膦酸鹽與二價陽離子可形成難溶復合物。因此，本品與含有二價陽離子的食物或藥物（如抗酸劑或鐵制劑）同時服用。
