急性黃疸型乙型肝炎的整個病程一般分為3個階段，即黃疸前期、黃疸期和恢復期，其臨床表現如下：
（1）黃疸前期從患者開始有癥狀到出現黃疸這段時間，約為數日至2周。起病時患者常感畏寒、發熱，體溫38℃左右，少數患者可持續高熱數日。更為突出的癥狀是全身疲乏無力、食欲減退、惡心、嘔吐，尤其厭惡油膩食物，上腹部堵脹滿悶，尿黃似濃茶水，大便較稀或便秘。在這階段因個體差異、患者表現復雜多樣易被誤診，應特別注意，如有的患者表現為上呼吸道炎癥，類似感冒。有些患者可伴關節酸痛而被誤認為風濕病。也有少數人有劇烈腹痛而誤認為急腹癥。還有少數人可出現等麻疹。此期中末，查體可發現肝區叩擊痛及壓痛，半數以上患者肋緣下可觸及肝臟，血清丙氨酸氨基轉移酶（ALT）明顯升高，尿膽紅素陽性。乙肝表面抗原陽性、乙肝核心抗體免疫球蛋白M（抗—HBcIgM）陽性。此期患者的血液、大小便、嘔吐物中均含有大量肝炎病毒，因而有很強的傳染性。
（2）黃疸期患者鞏股（白睛部分）、皮膚及粘膜黃染，于數日到2周達高峰。此時發熱漸退，消化癥狀卻進一步加重。肝臟腫大壓痛，約10%—35%的患者脾臟亦腫大并能觸及。血象白細胞正常或稍偏低，肝功能試驗明顯異常，血清膽紅素在17微摩爾/升（1.0毫克見）以上。此期一般約持續2－6周。
（3）恢復期黃疸漸消退，癥狀逐步消失，肝、脾腫大日漸回縮，肝功能趨向恢復直至正常，為期約4周。