拉曼光譜優點：提供快速、簡單、可重復、且更重要的是無損傷的定性定量分析，它無需樣品準備，樣品可直接通過光纖探頭或者通過玻璃、石英、和光纖測量；水的拉曼散射很微弱，拉曼光譜是研究水溶液中的生物樣品和化學化合物的理想工具；拉曼一次可以同時覆蓋50-4000波數的區間，可對有機物及無機物進行分析，相反，若讓紅外光譜覆蓋相同的區間則必須改變光柵、光束分離器、濾波器和檢測器。
化學結構分析中，獨立的拉曼區間的強度可以和功能集團的數量相關；因為激光束的直徑在它的聚焦部位通常只有0.2-2毫米，常規拉曼光譜只需要少量的樣品就可以得到。。這是拉曼光譜相對常規紅外光譜一個很大的優勢。而且，拉曼顯微鏡物鏡可將激光束進一步聚焦至20微米甚至更小，可分析更小面積的樣品；共振拉曼效應可以用來有選擇性地增強大生物分子特個發色基團的振動，這些發色基團的拉曼光強能被選擇性地增強1000到10000倍。
拉曼光譜不足之處： (1)、拉曼散射面積； (2)、不同振動峰重疊和拉曼散射強度容易受光學系統參數等因素的影響； (3)、熒光現象對傅立葉變換拉曼光譜分析的干擾 ； (4)、在進行傅立葉變換光譜分析時，常出現曲線的非線性的問題 ； (5)、任何一物質的引入都會對被測體體系帶來某種程度的污染，這等于引入了一些誤差的可能性，會對分析的結果產生一定的影響。