本病的發病機理尚不清楚。由于這些合成酶抗體的抗原成分是由蛋白及與之相結合的tRNA組成，在催化細胞中游離氨基酸與相應tRNA結合、并以mRNA為模板形成多肽中發揮了重要作用。臨床研究還發現，抗合成酶抗體的滴度和疾病的嚴重程度有密切關系，隨抗體滴度的增高而病情加重，病情緩解期滴度明顯下降。故推測抗合成酶抗體可能是引起組織損傷的直接因素，其作用機理包括直接結合靶抗原，交叉反應和激活補體，最終引起免疫炎性反應。另外，遺傳學研究發現，該綜合癥與DRW52和DR3相關。
