整個操作過程需要在凈化臺內進行，并且要求潔凈度為100級；其次，要按照相關示意圖安裝好濾頭，并且進行滅菌后，備用。把試驗品用滅菌容積溶解以后，吸入滅菌注射器內，*后注入濾器玻璃筒內，連同儀器底座進行培養就可以，或者也可以濾頭脫離底座進行培養。
有用戶培養箱容量有限，也可以采用如下操作方法：把已經抽干的試驗品溶液的濾頭從底座拔出，同時在濾頭下端螺絲管排液口塞住橡膠套塞。然后把濾頭與底座分別放置培養箱內進行培養。
微生物限度檢驗儀功能特點：
1、可檢測固態、液態、表面、膏狀、漿狀樣本；
2、樣本在檢測時無需任何的前處理過程，直接丟入搖搖瓶即可；
3、檢測樣本只需1ml/1g；同一溫度下可同時檢測6個樣品；
4、靈敏度高達可檢測到1目標微生物；特異性高達99.999%；
5、簡單三個操作步驟，傻瓜型，無需專業操作人員；
6、儀器便攜式，可直接連接電腦出定量分析檢測報告，并可隨時隨地進行檢測、100%定量分析。
7、檢測瓶使用后安全丟棄-和過期藥物同樣處理。