1.病人的自身情況：CAR-T療法的首要條件是能夠從病人身上收集足夠的高質量的T細胞。某些病人，由于前期化療，或者疾病很嚴重，體內T細胞數量和質量都無法滿足CAR-T療法所需要的T細胞。另外，腦內腫瘤負荷大的病人，考慮到致命的不良反應，也是不能馬上用CAR-T療法。
2.CAR-T的制造工藝和過程：CAR-T療法過程很復雜和高端。涉及T細胞的篩選收集、基因改造、活化、培養、擴增、修飾等，每一步都需要精心的設計和質量控制，哪一步出現差錯都會影響CAR-T療法。比如，有案例顯示，T細胞中混入了B細胞雜質，導致病人對CAR-T療法產生抗性。這說明細胞的純度非常重要。
3.腫瘤自身的特性：有研究顯示，接受抗CD19和抗CD22的CAR-T細胞療法后一年內有近一半的病人腫瘤復發。這和腫瘤逃逸和CART持續性有很大關系。如何找到更多的腫瘤靶點并盡可能殺盡腫瘤，如何增加CART在體內的持續性還是有待改進和開發。
4.治療的不良反應：一般來說，有細胞因子釋放風暴的不良反應，表明機體對治療有反應，殺滅腫瘤有效果。但是嚴重不良反應往往需要提前采取措施中斷CAR-T細胞在體內的殺滅作用。這是否會影響消滅腫瘤的最終效果，還有待進一步評估。
體內腫瘤負荷：最近紀念斯隆·凱特琳癌癥研究中心（MSKCC）的研究顯示，CAR-T細胞治療前體內腫瘤負荷較輕（異常增生的原始細胞<5%）的患者，他們的治療效果更好，長期緩解率更高。
另外，上述實驗也顯示，CAR-T細胞治療后完全緩解率與病人是否進行過骨髓移植、化療種類、患者年齡、做過幾種治療以及CAR-T的劑量等因素基本上都沒有關系。