1、不可逆性抑制劑主要與酶共價結合
不可逆抑制性作用（irreversible inhibition）的抑制劑通常和酶活性中心上的必需基團以共價鍵相結合，使酶失活。此種抑制劑不能用透析、超濾等方法予以去除。
2、可逆性抑制劑與酶和（或）酶-底物復合物非共價結合
可逆性抑制作用（reversible inhibition）的抑制劑通過非共價鍵與酶和（或）酶-底物復合物可逆性結合，使酶活性降低或消失。采用透析或超濾可將抑制劑除去。一下是3種常見的可逆性抑制作用。
1）競爭性抑制 （competitive inhibition）
抑制物與底物結構類似，可與底物競爭酶的活性中心，從而阻礙酶和底物結合成中間產物。
2）非競爭性抑制 （non-competitive inhibition）
有些抑制劑與酶活性中心外的必需基團相結合，不影響酶與底物的結合。底物與抑制劑之間無競爭關系。但酶-底物-抑制劑復合物（ESI）不能進一步釋放出產物 [6]
。
3）反競爭性抑制 （uncompetitive inhibition）
此類抑制劑僅與酶和底物形成的中間產物（ES）結合，是中間產物的量下降。這樣，既減少從中間產物轉化為產物的量，也同時減少從中間產物解離出游離酶和底物的量。