(一)發病原因
淀粉樣物質在器官組織細胞外進行性沉積，引起身體多臟器功能障礙，過去按引起淀粉樣變病的原因一般分為：原發性；合并骨髓瘤、繼發性、局灶性、遺傳性以及其他少見類型。
大多原發性及合并骨髓瘤淀粉樣變病的淀粉樣蛋白來自L鏈的免疫球蛋白-AL蛋白，繼發性淀粉樣變病可由許多疾病誘發，局灶性淀粉樣變病為單一器官淀粉樣物質沉積，不累及全身，遺傳性淀粉樣變病多為常染色體顯性遺傳，以家族性淀粉樣多神經病變(familial amyloid polyneuropathy，FAP)為代表，但家族性地中海熱為常染色體隱性遺傳，除局灶性外，以上各型均為多系統損害，又統稱全身性淀粉樣變病，但實際上消化道癥狀發病率高的FAP的消化管壁淀粉樣纖維沉著比其他類型都輕。
據研究，FAP消化道癥狀程度與活檢所見淀粉樣纖維沉積程度缺乏聯系，FAP的消化管自主神經的病變則是嚴重的，根據尸檢，迷走神經主干，神經外膜以及神經內膜都可見顯著的淀粉樣纖維沉積，髓神經纖維幾乎完全消失，并且在腹腔神經節內也可查見淀粉樣纖維沉積，消化管壁的神經叢(Meissner神經叢和Auerbach神經叢)可見淀粉樣纖維沉積和神經節細胞數顯著減少，應用兒茶酚胺熒光法對直腸黏膜進行自主神經纖維檢查，FAP的病例中從比較早期即可見到含兒茶酚胺神經纖維的重度脫落，顯示消化管的脫神經支配狀態，同樣的消化管自主神經病變，在原發性和伴隨骨髓瘤的淀粉樣變病中也有所見，消化管的淀粉纖維沉著和大范圍內的自主神經障礙，引起了全身性淀粉樣變病的多種多樣消化道癥狀。
近年由于弄清了不同種類纖維蛋白對沉積組織的親和性的差別，按沉積的纖維蛋白類別的分類逐漸得到確立。
1.AL蛋白 對消化道親和性高的淀粉樣蛋白多引起全身性淀粉樣變病，由免疫球蛋白L鏈的易變區(variant region)的全部和一部分組成稱為AL蛋白，原發性淀粉樣變病起病多在40歲以上，原因不明，發生在以往完全健康者，無誘發疾病，合并骨髓瘤淀粉樣變病的淀粉樣蛋白也來自L鏈的免疫球蛋白——AL蛋白，由患者血清中M蛋白的L鏈或尿中本-周蛋白的分解產物變形而成。
2.AA蛋白 在炎癥，感染時，臨床遇到的多是增加的以急性期血清中的蛋白(serum amyloid A protein，SAA)作為前軀體的淀粉樣A蛋白(AA蛋白)，由SAA水解而成，由76個氨基酸構成，與免疫球蛋白無關，繼發性淀粉樣變病可由許多疾病誘發，如類風濕性關節炎，慢性感染包括結核，骨髓炎，肺膿腫，支氣管擴張，慢性腎盂腎炎，炎癥性腸病，真菌病等；也見于腫瘤，如Hodgkin病，甲狀腺髓樣癌等。
(二)發病機制
關于淀粉樣變病胃腸道癥狀的發生機制，過去一直認為有兩個方面：
1.由于消化管壁內血管的淀粉樣纖維沉著，引起消化道缺血。
2.肌層破壞，運動功能減弱。
在有明顯淀粉樣纖維沉積的消化管管壁，肉眼觀察可見整個管壁變硬，肥厚，缺乏彈性，漿膜面有不少小顆粒隆起，上述變化有時不一定累及整個消化管，而是呈現節段性分布，有時可表現一部分腸管明顯擴張，組織學觀察大多限于尸檢病例，消化管各層都可見到淀粉樣纖維沉積，以黏膜下組織的血管壁最明顯，其次為固有肌層及黏膜層，淀粉樣纖維沉積的血管壁肥厚，腔狹窄，血管周圍的結締組織也可看到淀粉樣纖維沉積，特別在腫塊形成和管壁肥厚明顯的部位，固有肌層的淀粉樣沉積顯著。
胃，小腸，大腸的淀粉樣纖維沉積程度在各型之間以及個體之間存有差異，以原發性及伴隨骨髓瘤性淀粉樣變病者明顯，而在FAP患者較輕，從部位上看，胃，小腸的淀粉樣沉積，黏膜固有層的沉積也比較明顯，在原發性淀粉樣變病及FAP中，胃黏膜內淀粉樣纖維沉積較大腸嚴重。