1.新生兒期生糖基質不足
小嬰兒由于宮內營養不良，早產兒由于孕期不足，雙胎中較小嬰兒由于胎內血供較少，故體內糖原貯存量較少，而腦細胞代謝所需要的糖原量卻并不低，而腎上腺素的反應又不活躍，故容易出現低血糖。
2.新生兒高胰島素血癥
糖尿病母親的嬰兒可有暫時性高胰島素血癥。該類新生兒生后由于孕母高血糖，導致胎兒血糖升高，刺激胎兒胰島增生，胰島素分泌亢進，促進糖原、脂肪、蛋白質的合成，形成巨大兒。娩出后，突然失去母體高濃度的葡萄糖供應，但胰島素分泌仍然旺盛，同時又有胰升糖素的分泌減少，故內生葡萄糖的產生量減少，因而易于發生低血糖。
3.嬰兒和兒童的高胰島素血癥
高胰島素血癥可發生于任何年齡，新生兒期高胰島素血癥亦可以不是糖尿病母親引起的
4.內分泌激素的缺乏
皮質醇和生長激素是主要拮抗胰島素的激素，是維持血糖在體內穩定的重要因素。單純的生長激素缺乏或全垂體功能減低者，和（或）促腎上腺皮質激素（ACTH）-糖皮質激素不足，使糖原異生的酶活性和基質生成減少，糖異生障礙，空腹時出現低血糖。腎上腺髓質缺乏反應的人當血糖降低時，腎上腺素的分泌不增加，不能促進糖原的分解，以致血糖不能上升，常停留在低水平，胰升糖素缺乏也會引起低血糖。
5.遺傳代謝性疾病導致的低血糖
楓糖尿癥、糖原積累癥、糖異生的疾病可導致低血糖。
6.酶的缺乏及其他原因
其他如肝臟的損害；藥物中毒；小腸吸收減少；難控制的低血糖發作。